Taq-DNA-Ligase

DNA-Ligase
Andere Namen	Polydesoxyribonukleotidsynthase [NAD(+)]
Masse/Länge Primärstruktur	674 Aminosäuren, 76.527 Da
Bezeichner
Externe IDs	UniProt: B7A6G7;
Enzymklassifikation
EC, Kategorie	6.5.1.2

Die Taq-DNA-Ligase ist ein Enzym aus der Gruppe der DNA-Ligasen und wird von Thermus aquaticus gebildet.

Eigenschaften

Die Taq-DNA-Ligase erzeugt je eine Phosphodiesterbindung zwischen zwei aneinandergrenzenden DNA-Sequenzen in DNA-Doppelsträngen und dient der Bakterie zur DNA-Replikation, Rekombination und zur DNA-Reparatur. Cofaktoren sind zweiwertige Magnesiumionen.

Die Taq-DNA-Ligase katalysiert die Reaktion:

NAD⁺ + (Desoxyribonukleotid)(n) + (Desoxyribonukleotid)(m) $\rightleftharpoons$ AMP + beta-Nicotinamid-D-ribonukleotid + (Desoxyribonukleotid)(n+m)

Anwendungen

Die Taq-DNA-Ligase wird im Zuge einer künstlichen Gensynthese zur mehrfachen, parallelen Ligation jeweils zweier DNA-Doppelstränge aneinander verwendet,[1] ist jedoch bei einer Verwendung der Gibson Assembly zur Klonierung nicht notwendig.[2] Die Taq-Ligase wird im Zuge einer PCR-Optimierung zur Erzeugung langer Produkte eingesetzt, jedoch unabhängig von der Ligase-Aktivität.[3] Weiterhin wird die Taq-DNA-Ligase zur Ligase-Kettenreaktion eingesetzt.[4]

Weblinks

MeSH Taq-DNA-Ligase

Einzelnachweise

D. G. Gibson: Enzymatic assembly of overlapping DNA fragments. In: Methods in enzymology. Band 498, 2011, S. 349–361, doi:10.1016/B978-0-12-385120-8.00015-2, PMID 21601685.
R. M. Benoit, C. Ostermeier, M. Geiser, J. S. Li, H. Widmer, M. Auer: Seamless Insert-Plasmid Assembly at High Efficiency and Low Cost. In: PloS one. Band 11, Nummer 4, 2016, S. e0153158, doi:10.1371/journal.pone.0153158, PMID 27073895, PMC 4830597 (freier Volltext).
K. B. Ignatov, V. M. Kramarov: DNA ligases from thermophilic bacteria enhance PCR amplification of long DNA sequences. In: Biochemistry. Biokhimiia. Band 74, Nummer 5, Mai 2009, S. 557–561, PMID 19538130.
M. Wiedmann, W. J. Wilson, J. Czajka, J. Luo, F. Barany, C. A. Batt: Ligase chain reaction (LCR)–overview and applications. In: PCR methods and applications. Band 3, Nummer 4, Februar 1994, S. S51–S64, ISSN 1054-9803. PMID 8173509. (PDF).

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[1] D. G. Gibson: Enzymatic assembly of overlapping DNA fragments. In: Methods in enzymology. Band 498, 2011, S. 349–361, doi:10.1016/B978-0-12-385120-8.00015-2, PMID 21601685.

[2] R. M. Benoit, C. Ostermeier, M. Geiser, J. S. Li, H. Widmer, M. Auer: Seamless Insert-Plasmid Assembly at High Efficiency and Low Cost. In: PloS one. Band 11, Nummer 4, 2016, S. e0153158, doi:10.1371/journal.pone.0153158, PMID 27073895, PMC 4830597 (freier Volltext).

[3] K. B. Ignatov, V. M. Kramarov: DNA ligases from thermophilic bacteria enhance PCR amplification of long DNA sequences. In: Biochemistry. Biokhimiia. Band 74, Nummer 5, Mai 2009, S. 557–561, PMID 19538130.

[4] M. Wiedmann, W. J. Wilson, J. Czajka, J. Luo, F. Barany, C. A. Batt: Ligase chain reaction (LCR)–overview and applications. In: PCR methods and applications. Band 3, Nummer 4, Februar 1994, S. S51–S64, ISSN 1054-9803. PMID 8173509. (PDF).