RIG-I
RIG-I (retinoic acid inducible gene I) ist ein zu den Helikasen gehörender intrazellulärer Rezeptor des angeborenen Immunsystems von Säugetieren, der bei der Erkennung von mehreren RNA-Viren (unter anderem Hepatitis C, Influenza) eine zentrale Rolle spielt. Der natürliche Ligand von RIG-I wurde erst 2006 identifiziert. Erkannt werden einzel- und doppelsträngige Ribonukleinsäuren mit einem Triphosphat am 5'-Ende. Diese Triphosphat-RNA wird von viralen Polymerasen, sowie der zellulären RNA-Polymerase III erzeugt.
RIG-I | ||
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Darstellung basierend auf PDB 2QFB | ||
Vorhandene Strukturdaten: 2LWD, 2LWE, 2QFB, 2QFD, 2RMJ, 2YKG, 3LRN, 3LRR, 3NCU, 3OG8, 3TMI, 3ZD6, 3ZD7, 4AY2, 4BPB, 4NQK, 4ON9, 4P4H | ||
Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
Masse/Länge Primärstruktur | 925 Aminosäuren | |
Sekundär- bis Quartärstruktur | Monomer; nach Virenkontakt Homomultimer | |
Isoformen | 2 | |
Bezeichner | ||
Gen-Namen | DDX58 RIG-I; RIGI; RLR-1; SGMRT2 | |
Externe IDs | ||
Enzymklassifikation | ||
EC, Kategorie | 3.6.1.-, Helikase | |
Reaktionsart | Entdrillung doppelsträngiger RNA | |
Vorkommen | ||
Homologie-Familie | DEAD-Helikasen | |
Übergeordnetes Taxon | Euteleostomi | |
Orthologe | ||
Mensch | Hausmaus | |
Entrez | 23586 | 230073 |
Ensembl | ENSG00000107201 | ENSMUSG00000040296 |
UniProt | O95786 | Q6Q899 |
Refseq (mRNA) | NM_014314 | NM_172689 |
Refseq (Protein) | NP_055129 | NP_766277 |
Genlocus | Chr 9: 32.46 – 32.53 Mb | Chr 4: 40.2 – 40.24 Mb |
PubMed-Suche | 23586 | 230073 |
RIG-I wird durch Interferon-α, -β, -γ und bakterielle Lipopolysaccharide aktiviert. Bei Bindung des Monomers an die Triphosphat-RNA findet eine Konformationsänderung statt und der Rezeptor multimerisiert. So wird anschließend die MAVS/IPS1-Signalkaskade ausgelöst, die zur Aktivierung von NF-κB, IRF3, IRF7 und zur Ausschüttung antiviraler Zytokine wie Interferon-β und CCR5 führt.[1]
Weblinks
- A. Ablasser, F. Bauernfeind, G. Hartmann, E. Latz, K. A. Fitzgerald, V. Hornung: RIG-I-dependent sensing of poly(dA:dT) through the induction of an RNA polymerase III-transcribed RNA intermediate. In: Nature Immunology. Band 10, Nummer 10, Oktober 2009, S. 1065–1072, doi:10.1038/ni.1779, PMID 19609254, PMC 3878616 (freier Volltext).