Birnaviridae

Die Familie Birnaviridae umfasst d​rei Gattungen (Genera) v​on Virusspezies m​it doppelsträngiger RNA, d​ie ähnlich d​er Familie Partitiviridae i​n zwei Segmenten vorliegt. Von d​er Eigenschaft dieser Segmentierung (bi-RNA) leitet s​ich der Familienname ab. Die Viren dieser Familie h​aben keine Ähnlichkeiten i​n der Nukleinsäuresequenz m​it anderen Virustaxa. Die VP4-Protease d​er Birnaviridae z​eigt Homologien z​u einer ATP-abhängigen Protease i​n Bakterien u​nd Organellen. Nach neueren Untersuchungen g​ibt es Ähnlichkeiten i​n der Sekundärstruktur d​es viralen RNA-abhängigen RNA-Polymerase (RdRP) d​er Birnaviridae z​u Mitgliedern d​er früheren Familie Tetraviridae (2011 v​om International Committee o​n Taxonomy o​f Viruses (ICTV) aufgeteilt i​n die Familien Alphatetraviridae, Carmotetraviridae u​nd Permutotetraviridae.[3][4] Diese Befunde lassen d​en Schluss zu, d​ass die Birnaviridae z​u den evolutionsgeschichtlich ältesten Viren gehören.

Birnaviridae

Virion v​on IBDV, Avibirnavirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[1]
Reich: Orthornavirae[2]
Phylum: nicht klassifiziert[2]
Ordnung: nicht klassifiziert[2]
Familie: Birnaviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsRNA, 2 Segmente
Baltimore: Gruppe 3
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Birnaviridae
Links
NCBI Taxonomy: 10993
ViralZone (Expasy, SIB): 162
ICTV Taxon History: 201902745

Systematik

Innere Systematik

Die folgende Gliederung i​n Gattungen d​er Birnaviridae f​olgt den Vorgaben d​es International Committee o​n Taxonomy o​f Viruses (ICTV) m​it Stand November 2018,[3]

  • Familie Birnaviridae
  • Der Familie gehört nach Vorschlag noch folgende Spezies an, die noch keiner Gattung zugeordnet werden konnte:
    • Spezies ‚Rotifer-Birnavirus‘ (RBV)[5]

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Birnaviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[6] In unmittelbarer verwandtschaftlicher Nachbarschaft finden sich die Familien, die früher als ‚Tetraviridae‘ zusammengefasst wurden: Alphatetraviridae, Carmotetraviridae und Permutotetraviridae (von den Autoren noch nicht unterschieden).[7] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4); es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Dieser Vorschlag i​st inzwischen abgelöst d​urch die Master species List #35 d​es ICTV v​om März 2020[2] Eine Gegenüberstellung d​er Kladogramme findet s​ich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.

Literatur
  • P. Dobos, B. J. Hill, R. Hallett, D. T. Kells, H. Becht, D. Teninges: Biophysical and biochemical characterization of five animal viruses with bisegmented double-stranded RNA genomes. In: J Virology, 1979, 32(2), S. 593–605, PMID 228080 (mit EM-Bildern)
  • B. Delmas, F.S.B. Kibenge et al.: Family Birnaviridae. In: C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London San Diego 2004, S. 561 ff.

Einzelnachweise
  1. ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
  2. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. Master Species List 2018a v1 ICTV, MSL (#33) including all taxa updates since the 2017 release. Herbst 2018
  4. AE Gorbalenya, FM Pringle, JL Zeddam, BT Luke, CE Cameron, J Kalmakoff, TN Hanzlik, KH Gordon, VK Ward: The palm subdomain-based active site is internally permuted in viral RNA-dependent RNA polymerases of an ancient lineage. In: J Mol Biol., 2002, 15;324(1), S. 47–62, PMID 12421558
  5. Michel Comps, Bruno Menu: Infectious diseases affecting mass production of the marine rotifer Brachionus plicatilis, in: Hydrobiologia, Dezember 1997, Volume 358, Issue 1–3, S. 179–183
  6. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  7. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Mai 2015, S. 479–480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
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