TFIIH-Helikase XPD
Die TFIIH-Helikase XPD ist ein Enzym im Zellkern von Pilzen und Tieren, das als Teil des Transkriptionsfaktors IIH (TFIIH) die Öffnung des DNA-Doppelstrangs katalysiert, nachdem der Präinitiationskomplex zusammengebaut wurde. Dieser Reaktionsschritt ist Teil der Initiation der Transkription aller eukaryotischen Gene. Außerdem spielt XPD eine ganz ähnliche Rolle bei der DNA-Reparatur. Mutationen im menschlichen ERCC2-Gen, das für XPD codiert, können zur seltenen Erbkrankheit Xeroderma pigmentosum Typ D führen, bei der das Risiko für Hautkrebs stark erhöht ist, oder zum Tay-Syndrom, einer seltenen Ichthyose, oder zum Cockayne-Syndrom Typ 2.[2]
TFIIH-Helikase XPD | ||
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Eigenschaften des menschlichen Proteins | ||
Masse/Länge Primärstruktur | 760 Aminosäuren | |
Kofaktor | Mg2+ | |
Bezeichner | ||
Gen-Name | ERCC2 | |
Externe IDs | ||
Enzymklassifikation | ||
EC, Kategorie | 3.6.4.12, Helikase | |
Reaktionsart | Hydrolyse, Isomerisierung | |
Substrat | ATP + ds-DNA | |
Produkte | ADP + Phosphat + ds-DNA mit 'Blase' | |
Vorkommen | ||
Übergeordnetes Taxon | Tiere, Pilze[1] | |
Orthologe | ||
Mensch | Hausmaus | |
Entrez | 2068 | 13871 |
Ensembl | ENSG00000104884 | ENSMUSG00000030400 |
UniProt | P18074 | O08811 |
Refseq (mRNA) | NM_000400 | NM_007949 |
Refseq (Protein) | NP_000391 | NP_031975 |
Genlocus | Chr 19: 45.35 – 45.37 Mb | Chr 7: 19.38 – 19.4 Mb |
PubMed-Suche | 2068 | 13871 |
Die Öffnung des Doppelstrangs verbraucht ein Molekül ATP und umspannt die Basen von −10 bis +2 bezüglich des Genanfangs. Unterstützt wird sie durch Entdrillung der DNA (sogenanntes negatives Supercoiling) mithilfe von TFIIE. An der DNA-Reparatur nimmt außerdem die XPB-Helikase teil. Die geöffnete DNA wird in beiden Fällen als DNA-Blase bezeichnet.[3]
XPB und XPD bilden einen Teil der Verteidigung der Zelle gegen retrovirale Infektionen, einer Laborstudie nach. Eine chinesische Studie fand, dass eine Kombination bestimmter XPB- und XPD-Varianten das Lungenkrebsrisiko erhöhte.[4][5]
Literatur
- Beck BD, Hah DS, Lee SH: XPB and XPD between transcription and DNA repair. In: Adv. Exp. Med. Biol.. 637, 2008, S. 39–46. PMID 19181109.
Einzelnachweise
- Homologe bei OMA
- UniProt P18074
- Reinberg/reactome: RNA Polymerase II Promoter Opening: First Transition
- Yoder K, Sarasin A, Kraemer K, McIlhatton M, Bushman F, Fishel R: The DNA repair genes XPB and XPD defend cells from retroviral infection. In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 103, Nr. 12, März 2006, S. 4622–7. doi:10.1073/pnas.0509828103. PMID 16537383. PMC 1450221 (freier Volltext).
- Hu Z, Xu L, Shao M, et al.: Polymorphisms in the two helicases ERCC2/XPD and ERCC3/XPB of the transcription factor IIH complex and risk of lung cancer: a case-control analysis in a Chinese population. In: Cancer Epidemiol. Biomarkers Prev.. 15, Nr. 7, Juli 2006, S. 1336–40. doi:10.1158/1055-9965.EPI-06-0194. PMID 16835333.