Ribothymidin

Ribothymidin ist ein eher seltenes Nukleosid, bei dem die Nukleinbase Thymin an die Pentose β-D-Ribofuranose gebunden ist. Dieses Nukleosid wird auch als 5-Methyluridin bezeichnet und kommt in Ribonukleinsäuren wie rRNA und tRNA vor.[2] Insbesondere ist es ein charakteristisches Bauelement in der TΨC-Schleife von tRNA.[3]

Strukturformel
Allgemeines
Name Ribothymidin
Andere Namen
  • T (Kurzcode), m5U (Kurzcode)
  • 5-Methyluridin
  • 1-β-D-Ribofuranosyl-5-methylpyrimidin-2,4-dion
  • 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-2,4-dion
  • Thyminribosid
Summenformel C10H14N2O6
Externe Identifikatoren/Datenbanken
CAS-Nummer 1463-10-1
EG-Nummer 215-973-9
ECHA-InfoCard 100.014.522
PubChem 445408
Wikidata Q425078
Eigenschaften
Molare Masse 258,23 g·mol−1
Aggregatzustand

fest

Schmelzpunkt

183–184 °C[1]

Sicherheitshinweise
GHS-Gefahrstoffkennzeichnung [1]
keine GHS-Piktogramme
H- und P-Sätze H: keine H-Sätze
P: keine P-Sätze [1]
Soweit möglich und gebräuchlich, werden SI-Einheiten verwendet. Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten bei Standardbedingungen.

Ribothymidin wird auch kurz Thymidin genannt (Kürzel: T); das standardmäßig in der DNA vorkommende Analogon mit Desoxyribose ist das Desoxythymidin (Kürzel: dT).

Eine tRNAAla aus S. cerevisiae.
Ribothymidin ist hier mit T gekennzeichnet.

Einzelnachweise
  1. Datenblatt 5-Methyluridin bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 11. März 2011 (PDF).
  2. Patrick A. Limbach, Pamela F. Crain, James A. McCloskey: „Summary: the modified nucleosides of RNA“, Nucleic Acids Research, 1994, 22 (12), S. 2183–2196 (doi:10.1093/nar/22.12.2183, PMC 523672 (freier Volltext), PMID 7518580).
  3. Robert W. Holley, Jean Apgar, George A. Everett, James T. Madison, Mark Marquisee, Susan H. Merrill, John Robert Penswick, Ada Zamir: „Structure of a Ribonucleic Acid“, Science, 1965, 147, S. 1462–1465 (doi:10.1126/science.147.3664.1462).
  • Eintrag zu Ribothymidine in der Human Metabolome Database (HMDB), abgerufen am 24. September 2013.
  • Modification Summary von 5-methyluridine in der Modomics-Datenbank, abgerufen am 14. Januar 2014.
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