Alphaproteobacteria

Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet e​ine Klasse i​m phylogenetischen System d​er Bakterien, d​as auf d​er Grundlage d​er Basensequenz d​er ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören z​um Stamm (Phylum) d​er Proteobacteria,

Alphaproteobacteria

Agrobacterium tumefaciens (Rhizobiales) a​n einer Möhrenzelle (sekundärelektronenmikroskopisches Bild)

Systematik
Klassifikation: Lebewesen
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Abteilung: Proteobacteria
Klasse: Alphaproteobacteria
Wissenschaftlicher Name
Alphaproteobacteria
Garrity et al. 2006

Systematik

Zu d​en Alphaproteobacteria gehören d​ie Ordnungen[1]

  • Caulobacterales Henrici & Johnson 1935
  • Iodidimonadales Iino et al. 2016
  • Kiloniellales Wiese et al. 2009
  • Kordiimonadales Kwon et al. 2005
  • Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
  • Micropepsales Harbison et al. 2017
  • Parvularculales Cho und Giovannoni 2003
  • Rhizobiales Kuykendall 2006
  • Rhodobacterales Garrity et al. 2006
  • Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971
  • Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
  • Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
  • Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006

sowie

  • Pelagibacterales Grote et al. 2012[2]
  • Holosporales Wang und Wu 2013; Martijn et al. 2018[3]

und zahlreiche, bisher n​icht sicher eingeordnete Isolate.

Wichtige Vertreter s​ind unter anderem i​n den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella u​nd Nitrobacter z​u finden. Unter d​en Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien i​n Gewässerproben zeigen o​ft oligotrophe Verhältnisse an.

Stammbaum der Alphaproteobacteria auf Basis ribosomaler RNA (rRNA)
 Magnetococcidae 

Magnetococcus marinus


   
 Caulobacteridae 

Caulobacterales, Rhodospirillales, Sphingomonadales,
Rhodobacteraceae, Rhizobiales, etc.


   

Holosporales



 Rickettsidae 

 Pelagibacterales 

Untergruppen Ia (Pelagibacteraceae, m​it Pelagibacter), Ib, II, IIIa, IIIb, IV u​nd V


   

Proto-Mitochondrien


   
 Anaplasmataceae 



Ehrlichia


   

Anaplasma



   

Wolbachia



   

Neorickettsia



   
 Midichloriaceae 

Midichloria



 Rickettsiaceae 

Rickettsia


   

Orientia









Vorlage:Klade/Wartung/Style
Kladogramm auf Basis des Vergleichs der 16S- und 23S-rRNA-Sequenzen.
Ferla et al.[3]

Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Ricketsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[4] und National Center for Biotechnology Information (NCBI)[5] sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts "The All-Species Living Tree"[6]) unter anderem:

  • Sneathiellales mit Sneathiella chinensis, S. chungangensis, S. glossodoripedis (basal in Rickettsiales[7][8] oder zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013))
  • Parvularculales mit Parvularcula bermudensis (nahe Rhodobacterales/Rhizobiales, Caulobacteridae)[9]
  • Iodidimonadales mit Iodidimonas muriae[10] zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
  • Kiloniellales mit Kiloniella laminarae zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
  • Kordiimonadales mit Kordiimonas gwangyangensis[11] zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
  • Micropepsales mit Micropepsis pineolensis (incerta sedis)[12]
  • Rhodovibrio mit Rhodovibrio salinarum, R. sodomensis (Rhodospirillaceae, Caulobacteridae)[13]
  • Micavibrio aeruginosavorus Kwon et al. 2005 (incerta sedis)
  • Vibrio adaptatus und V. cyclosites (nach Muir et al. 1990 nicht Gattung Vibrio, sondern bisher nicht bezeichnete Gattung(en) der Alphaproteobacteria, incerta sedis)
  • Furvibacter Lee et al. 2007
  • Polymorphum gilvum Cai 2010
  • Subaequorebacter tamlense Lee 2006[14]
  • Tuberoidobacter mutans Nikitin 1983[15][16][17]

Quellen
  1. J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) - Class Alphaproteobacteria (Stand: 11. Januar 2019)
  2. Pelagibacterales, auf: NCBI Taxonomy Browser
  3. M. P. Ferla, J. C. Thrash, S. J. Giovannoni, W. M. Patrick: New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability. In: PLOS One. 8, Nr. 12, 2013, S. e83383. doi:10.1371/journal.pone.0083383. PMID 24349502. PMC 3859672 (freier Volltext).
  4. J.P. Euzéby: Alphaproteobacteria. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archiviert vom Original am 27. Januar 2013. Abgerufen am 26. April 2019.
  5. Sayers: Alphaproteobacteria. [National Center for Biotechnology Information] (NCBI) taxonomy database. Abgerufen am 26. April 2019.
  6. 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Abgerufen am 26. April 2019.
  7. Sneathiella, auf: LPSN
  8. Sneathiella glossodoripedis, auf: UniProt
  9. Jang-Cheon Cho, Stephen J. Giovannoni: Parvularcula bermudensis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium that forms a deep branch in the α-Proteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Band 53, Nr. 4, Juli 2003, S. 1031–1036, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.02566-0. PMID 12892122.
  10. Genus Iodidimonas, auf LPSN
  11. Order Kordiimonadales, auf LPSN
  12. Order Micropepsales, auf LPSN
  13. Rhodovibrio salinarum, auf: BacDive
  14. Subaequorebacter, auf: NCBI Taxonomy Browser
  15. Advances in Microbial Physiology, Vol. 24, Academic Press, 12. Juli 1983, ISBN 0-12-027724-7, S. 111
  16. Tuberoidobacter, on: IniProt Taxonomy
  17. Tuberoidobacter, auf: NCBI Taxonomy Browser

Literatur
  • Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.) The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria. 7 Bände, 3. Auflage, Springer-Verlag, New York u. a. O., 2006, ISBN 0-387-30740-0. Vol. 5: Proteobacteria: Alpha and Beta Subclass ISBN 0-387-30745-1
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