SLC-Transporter

SLC-Transporter i​st ein Sammelbegriff für e​twa 52 Familien v​on menschlichen Transportproteinen (so genannte Carrier o​der Membranproteine) m​it nahe 400 Genen. Solvate, d​ie transportiert werden, können geladene u​nd ungeladene organische Moleküle, s​owie anorganische Ionen sein.

Die Mitglieder d​er einzelnen Familien h​aben untereinander mindestens 20 Prozent Homologie. Die einzelnen Familien weisen zueinander f​ast keine Sequenzhomologie auf. Die Aufnahme e​ines neuen SLC-Mitglieds w​ird also über d​ie biologische Funktion, n​icht über d​ie evolutionäre Entwicklung entschieden. Eine allgemeingültigere, a​lso mehr Taxa umfassende Klassifikation, findet s​ich in d​er TCDB-Datenbank. Diese führt d​ie meisten d​er SLC-Familien n​eben vielen anderen Familien a​ls 2.A.x u​nd ist d​ie offizielle, v​on der IUBMB unterstützte Klassifikation d​er Transportproteine. Das SLC-Gen-Nomenklatur-System w​urde ursprünglich v​on der Human Genome Organisation (HUGO) vorgeschlagen u​nd ist Grundlage für d​ie offiziellen HUGO-Namen d​er Gene, d​ie diese Proteine kodieren.

Geschichte

Aus e​iner Zusammenarbeit v​on Harvard Medical School u​nd der Universität Zürich wurden s​eit 1999 – organisiert v​on Matthias Hediger, Peter Meier-Abt u​nd Heini Murer – Tagungen veranstaltet, d​ie dem wissenschaftlichen Austausch a​uf dem Feld d​er faszilativen u​nd sekundäraktiven Membrantransporter gewidmet s​ind und d​as aktuelle Wissen über Transporterphysiologie, -pathologie u​nd -pharmakologie zusammentragen. Im Jahr 2004 entstand e​in special issue z​u diesen Transportern,[1] d​ie im Pflügers Archiv – European Journal o​f Physiology erschienen sind.

Nomenklatur

Diese Genfamilie umfasst 50 verschiedene Familien (SLC1-50) mit bislang insgesamt 365 Genen, die jeweils für ein bestimmtes Transportprotein kodieren. Die Nomenklatur nummeriert die Familien von 1 bis 50, um dann mit alphabetischen Buchstaben die Nummern der einzelnen Transporter von den Nummern der Familien zu trennen. Eine phylogenetische Verwandtschaft wurde nicht berücksichtigt, da es sich um eine Liste menschlicher Gene handelt. Dies ist der Grund, warum in der aktuellen TCDB-Klassifikation keine SLC-Superfamilie aufgeführt ist.

Familien
  • (1) Hoch-affiner Glutamat- und neutraler Aminosäuretransporter[2]
    • (SLC1A1, SLC1A2, SLC1A3, SLC1A4, SLC1A5, SLC1A6, SLC1A7)
  • (2) Faszilitative GLUT-Transporter[3]
  • (3) Schwere Untereinheit der heteromeren Aminosäuretransporters[4]
    • (SLC3A1, SLC3A2)
  • (4) Bikarbonattransporter[5]
    • (SLC4A1, SLC4A2, SLC4A3, SLC4A4, SLC4A5, SLC4A6, SLC4A7, SLC4A8, SLC4A9, SLC4A10, SLC4A11)
  • (5) Natrium-Glucose-Transporter[6]
    • (SLC5A1, SLC5A2, SLC5A3, SLC5A4, SLC5A5, SLC5A6, SLC5A7, SLC5A8, SLC5A9, SLC5A10, SLC5A11, SLC5A12)
  • (6) Natrium- und Chlorid- abhängige Natrium:Neurotransmitter-Symporter[7]
    • (SLC6A1, SLC6A2, SLC6A3, SLC6A4, SLC6A5, SLC6A6, SLC6A7, SLC6A8, SLC6A9, SLC6A10, SLC6A11, SLC6A12, SLC6A13, SLC6A14, SLC6A15, SLC6A16, SLC6A17, SLC6A18, SLC6A19, SLC6A20)
  • (7) Kationischer Aminosäuretransporter/Glycoprotein-assoziierter Transporter[8]
    • (SLC7A1, SLC7A2, SLC7A3, SLC7A4, SLC7A5, SLC7A6, SLC7A7, SLC7A8, SLC7A9, SLC7A10, SLC7A11, SLC7A13, SLC7A14)
  • (8) Na+/Ca2+-Austauscher[9]
  • (9) Na+/H+-Austauscher[10]
    • (SLC9A1, SLC9A2, SLC9A3, SLC9A4, SLC9A5, SLC9A6, SLC9A7, SLC9A8, SLC9A9, SLC9A10, SLC9A11)
  • (10) Natrium-Gallsalz-Kotransporter[11]
    • (SLC10A1, SLC10A2, SLC10A3, SLC10A4, SLC10A5, SLC10A6, SLC10A7)
  • (11) Protonen-gekoppelter Metaliontransporter[12]
    • (SLC11A1, SLC11A2)
  • (12) Elektroneutraler Kation-Chlorid Kotransporter[13]
    • (SLC12A1, SLC12A2, SLC12A3, SLC12A4, SLC12A5, SLC12A6, SLC12A7, SLC12A8, SLC12A9)
  • (13) Menschlicher Na+-Sulfat/Carboxylat-Kotransporter[14]
    • (SLC13A1, SLC13A2, SLC13A3, SLC13A4, SLC13A5)
  • (14) Urea-Transporter[15]
    • (SLC14A1, SLC14A2)
  • (15) Protonen-Oligopeptid-Kotransporter[16]
    • (SLC15A1, SLC15A2, SLC15A3, SLC15A4)
  • (16) Monocarboxylat-Transporter[17]
    • (SLC16A1, SLC16A2, SLC16A3, SLC16A4, SLC16A5, SLC16A6, SLC16A7, SLC16A8, SLC16A9, SLC16A10, SLC16A11, SLC16A12, SLC16A13, SLC16A14)
  • (17) Vesikulärer Glutamattransporter[18]
    • (SLC17A1, SLC17A2, SLC17A3, SLC17A4, SLC17A5, SLC17A6, SLC17A7, SLC17A8, SLC17A9)
  • (18) Vesikulärer Amintransporter[19]
  • (19) Folat/Thiamin-Transporter[20]
  • (20) Typ III Na+/-Phosphat-Kotransporter[21]
    • (SLC20A1, SLC20A2)
  • (21) Organo-Anion-Transporter[22]
    • Unterfamilie 1 (SLCO1A2, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO1B4, SLCO1C1)
    • Unterfamilie 2 (SLCO2A1, SLCO2B1)
    • Unterfamilie 3 (SLCO3A1)
    • Unterfamilie 4 (SLCO4A1, SLCO4C1)
    • Unterfamilie 5 (SLCO5A1)
    • Unterfamilie 6 (SLCO6A1)
  • (22) Organischer Kation/Anion/Zwitterion-Transporter[23]
    • (SLC22A1, SLC22A2, SLC22A3, SLC22A4, SLC22A5, SLC22A6, SLC22A7, SLC22A8, SLC22A9, SLC22A10, SLC22A11, SLC22A12, SLC22A13, SLC22A14, SLC22A15, SLC22A16, SLC22A17, SLC22A18, SLC22A19, SLC22A20)
  • (23) Natriumabhängige Ascorbinsäuretransporter[24]
    • (SLC23A1, SLC23A2, SLC23A3, SLC23A4)
  • (24) Na+/(Ca2+-K+) Austauscher[25]
    • (SLC24A1, SLC24A2, SLC24A3, SLC24A4, SLC24A5, SLC24A6)
  • (25) Mitochondrialer Carrier[26]
  • (26) Multifunktionaler Anion-Austauscher[27]
    • (SLC26A1, SLC26A2, SLC26A3, SLC26A4, SLC26A5, SLC26A6, SLC26A7, SLC26A8, SLC26A9, SLC26A10, SLC26A11)
  • (27) Fettsäuretransporter[28]
    • (SLC27A1, SLC27A2, SLC27A3, SLC27A4, SLC27A5, SLC27A6)
  • (28) Na+-gekoppelter Nukleosid-Transport[29]
    • (SLC28A1, SLC28A2, SLC28A3)
  • (29) Faszilitativer Nukleosid-Transporter[30]
    • (SLC29A1, SLC29A2, SLC29A3, SLC29A4)
  • (30) Zinkefflux-Transporter[31]
    • (SLC30A1, SLC30A2, SLC30A3, SLC30A4, SLC30A5, SLC30A6, SLC30A7, SLC30A8, SLC30A9, SLC30A10)
  • (31) Kupfer-Transporter[32]
    • (SLC31A1)
  • (32) Vesikulärer inhibitorischer Aminosäure-Transporter[33]
    • (SLC32A1)
  • (33) Acetyl-CoA-Transporter[34]
    • (SLC33A1)
  • (34) Typ II Na+-Phosphat-Kotransporter[35]
    • (SLC34A1, SLC34A2, SLC34A3)
  • (35) Nukleosid-Zucker-Transporter[36]
    • Unterfamilie A (SLC35A1, SLC35A2, SLC35A3, SLC35A4, SLC35A5)
    • Unterfamilie B (SLC35B1, SLC35B2, SLC35B3, SLC35B4)
    • Unterfamilie C (SLC35C1, SLC35C2)
    • Unterfamilie D (SLC35D1, SLC35D2, SLC35D3)
    • Unterfamilie E (SLC35E1, SLC35E2, SLC35E3, SLC35E4)
  • (36) Protonen-gekoppelter Aminosäuretransporter[37]
    • (SLC36A1, SLC36A2, SLC36A3, SLC36A4)
  • (37) Zucker-Phosphat/Phosphat-Austauscher[38]
    • (SLC37A1, SLC37A2, SLC37A3, SLC37A4)
  • (38) System A & N, Natrium-gekoppelter neutraler Aminosäuretransporter[39]
    • (SLC38A1, SLC38A2, SLC38A3, SLC38A4, SLC38A5, SLC38A6)
  • (39) Metalion-Transporter[40]
    • (SLC39A1, SLC39A2, SLC39A3, SLC39A4, SLC39A5, SLC39A6, SLC39A7, SLC39A8, SLC39A9, SLC39A10, SLC39A11, SLC39A12, SLC39A13, SLC39A14)
  • (40) Basolateraler Eisentransporter[41]
  • (41) MgtE-ähnlicher Magnesiumtransporter[42]
    • (SLC41A1, SLC41A2, SLC41A3)
  • (42) Rh Ammonium-Transporter[43]
    • (RhAG, RhBG, RhCG)
  • (43) Na+-unabhängiger, System-L Aminosäure-Transporter
    • (SLC43A1, SLC43A2, SLC43A3)
  • (44) Choline-/ und Cholinverwandter Transporter
    • (SLC44A1, SLC44A2, SLC44A3, SLC44A4, SLC44A5)
  • (45) Vermutlicher Zuckertransporter
    • (SLC45A1, SLC45A2, SLC45A3, SLC45A4)
  • (46) Folat-Transporter[44]
  • (47) Multidrogen und Giftstoff-Extrusion
    • SLC47A1 (=MATE1, multidrug and toxin extrusion 1), SLC47A2 (=MATE2-K, multidrug and toxin extrusion 2 - kidney)
  • (48) Häm-Transporter

Einzelnachweise
  1. MA Hediger, MF Romero, JB Peng, A Rolfs, H Takanaga, EA Bruford: The ABCs of solute carriers: physiological, pathological and therapeutic implications of human membrane transport proteinsIntroduction. In: Pflügers Archiv, 2004 Feb;447(5), S. 465–468. PMID 14624363
  2. Y Kanai, MA Hediger: The glutamate/neutral amino acid transporter family SLC1: molecular, physiological and pharmacological aspects. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 469–479. doi:10.1007/s00424-003-1146-4. PMID 14530974.
  3. M Uldry, B Thorens: The SLC2 family of facilitated hexose and polyol transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 480–489. doi:10.1007/s00424-003-1085-0. PMID 12750891.
  4. Palacin M, Kanai Y: The ancillary proteins of HATs: SLC3 family of amino acid transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 490–494. doi:10.1007/s00424-003-1062-7. PMID 14770309.
  5. Romero MF, Fulton CM, Boron WF: The SLC4 family of HCO 3 - transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 490–494. doi:10.1007/s00424-003-1180-2. PMID 14722772.
  6. EM Wright, E Turk: The sodium/glucose cotransport family SLC5. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 510–518. doi:10.1007/s00424-003-1063-6. PMID 14722772.
  7. Chen NH, Reith ME, Quick MW: Synaptic uptake and beyond: the sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter family SLC6. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 519–531. doi:10.1007/s00424-003-1064-5. PMID 12719981.
  8. F Verrey, EI Closs, CA Wagner, M Palacin, H Endou, Y Kanai: CATs and HATs: the SLC7 family of amino acid transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 532–542. doi:10.1007/s00424-003-1086-z. PMID 14770310.
  9. BD Quednau, DA Nicoll, KD Philipson: The sodium/calcium exchanger family-SLC8. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 543–548. doi:10.1007/s00424-003-1065-4. PMID 12734757.
  10. J Orlowski, S Grinstein: Diversity of the mammalian sodium/proton exchanger SLC9 gene family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 549–565. doi:10.1007/s00424-003-1110-3. PMID 12845533.
  11. B Hagenbuch, P Dawson: The sodium bile salt cotransport family SLC10. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 566–570. doi:10.1007/s00424-003-1130-z. PMID 12851823.
  12. B Mackenzie, MA Hediger: SLC11 family of H+-coupled metal-ion transporters NRAMP1 and DMT1. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 571–579. doi:10.1007/s00424-003-1141-9. PMID 14530973.
  13. SC Hebert, DB Mount, G Gamba: Molecular physiology of cation-coupled Cl- cotransport: the SLC12 family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 580–593. doi:10.1007/s00424-003-1066-3. PMID 12739168.
  14. D Markovich, H Murer: The SLC13 gene family of sodium sulphate/carboxylate cotransporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 594–602. doi:10.1007/s00424-003-1207-8. PMID 12915942.
  15. C Shayakul, MA Hediger: The SLC14 gene family of urea transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 603–609. doi:10.1007/s00424-003-1124-x. PMID 12856182.
  16. H Daniel, G Kottra: The proton oligopeptide cotransporter family SLC15 in physiology and pharmacology. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 610–618. doi:10.1007/s00424-003-1101-4. PMID 12905028.
  17. AP Halestrap, D Meredith: The SLC16 gene family-from monocarboxylate transporters (MCTs) to aromatic amino acid transporters and beyond. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 619–628. doi:10.1007/s00424-003-1067-2. PMID 12739169.
  18. RJ Reimer, RH Edwards: Organic anion transport is the primary function of the SLC17/type I phosphate transporter family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 629–635. doi:10.1007/s00424-003-1087-y. PMID 12811560.
  19. LE Eiden, MK Schafer, E Weihe, B Schutz: The vesicular amine transporter family (SLC18): amine/proton antiporters required for vesicular accumulation and regulated exocytotic secretion of monoamines and acetylcholine. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 636–640. doi:10.1007/s00424-003-1100-5. PMID 12827358.
  20. V Ganapathy, SB Smith, PD Prasad: SLC19: the folate/thiamine transporter family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 641–646. doi:10.1007/s00424-003-1068-1. PMID 14770311.
  21. JF Collins, L Bai, FK Ghishan: The SLC20 family of proteins: dual functions as sodium-phosphate cotransporters and viral receptors. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 641–646. doi:10.1007/s00424-003-1088-x. PMID 12759754.
  22. B Hagenbuch, PJ Meier: Organic anion transporting polypeptides of the OATP/ SLC21 family: phylogenetic classification as OATP/ SLCO superfamily, new nomenclature and molecular/functional properties. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 653–665. doi:10.1007/s00424-003-1168-y. PMID 14579113.
  23. H Koepsell, H Endou: The SLC22 drug transporter family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 666–676. doi:10.1007/s00424-003-1089-9. PMID 12883891.
  24. H Takanaga, B Mackenzie, MA Hediger: Sodium-dependent ascorbic acid transporter family SLC23. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 677–682. doi:10.1007/s00424-003-1104-1. PMID 12845532.
  25. PP Schnetkamp: The SLC24 Na+/Ca2+-K+ exchanger family: vision and beyond. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 683–688. doi:10.1007/s00424-003-1069-0. PMID 14770312.
  26. F Palmieri: The mitochondrial transporter family (SLC25): physiological and pathological implications. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 689–709. doi:10.1007/s00424-003-1099-7. PMID 14598172.
  27. DB Mount, MF Romero: The SLC26 gene family of multifunctional anion exchangers. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 710–721. doi:10.1007/s00424-003-1090-3. PMID 12759755.
  28. A Stahl: A current review of fatty acid transport proteins (SLC27). In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 722–727. doi:10.1007/s00424-003-1106-z. PMID 12856180.
  29. JH Gray, RP Owen, KM Giacomini: The concentrative nucleoside transporter family, SLC28. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 728–734. doi:10.1007/s00424-003-1107-y. PMID 12856181.
  30. SA Baldwin, PR Beal, SY Yao, AE King, CE Cass, JD Young: The equilibrative nucleoside transporter family, SLC29. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 735–743. doi:10.1007/s00424-003-1103-2. PMID 12838422.
  31. RD Palmiter, L Huang: Efflux and compartmentalization of zinc by members of the SLC30 family of solute carriers. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 744–751. doi:10.1007/s00424-003-1070-7. PMID 12748859.
  32. MJ Petris: The SLC31 (Ctr) copper transporter family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 752–755. doi:10.1007/s00424-003-1092-1. PMID 12827356.
  33. B Gasnier: The SLC32 transporter, a key protein for the synaptic release of inhibitory amino acids. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 752–755. doi:10.1007/s00424-003-1091-2. PMID 12750892.
  34. Y Hirabayashi, A Kanamori, KH Nomura, K Nomura: The acetyl-CoA transporter family SLC33. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 760–762. doi:10.1007/s00424-003-1071-6. PMID 12739170.
  35. H Murer, I Forster, J Biber: The sodium phosphate cotransporter family SLC34. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 763–767. doi:10.1007/s00424-003-1072-5. PMID 12750889.
  36. N Ishida, M Kawakita: Molecular physiology and pathology of the nucleotide sugar transporter family (SLC35). In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 768–775. doi:10.1007/s00424-003-1093-0. PMID 12759756.
  37. M Boll, H Daniel, B Gasnier: The SLC36 family: proton-coupled transporters for the absorption of selected amino acids from extracellular and intracellular proteolysis family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 776–779. doi:10.1007/s00424-003-1073-4. PMID 12748860.
  38. L Bartoloni, SE Antonarakis: The human sugar-phosphate/phosphate exchanger family SLC37. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 780–783. doi:10.1007/s00424-003-1105-0. PMID 12811562.
  39. B Mackenzie, JD Erickson: Sodium-coupled neutral amino acid (System N/A) transporters of the SLC38 gene family. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 784–795. doi:10.1007/s00424-003-1117-9. PMID 12845534.
  40. DJ Eide: The SLC39 family of metal ion transporters. In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 796–800. doi:10.1007/s00424-003-1074-3. PMID 12748861.
  41. AT McKie, DJ Barlow: The SLC40 basolateral iron transporter family (IREG1/ferroportin/MTP1). In: Pflugers Arch. 447, Nr. 5, 2004, S. 801–806. doi:10.1007/s00424-003-1102-3. PMID 12836025.
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