Fiersviridae
Die Fiersviridae (veraltet: Leviviridae) sind eine Familie von Viren, die als Bakteriophagen verschiedene Bakterien, einschließlich Enterobakterien, Caulobacter, Pseudomonas und Acinetobacter befallen. Die Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018 kennt zwei Gattungen zu je zwei Spezis.[4][5]
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Kapsid des Bakteriophagen MS2 | ||||||||||||||
| Systematik | ||||||||||||||
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| Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||
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Es handelt sich um kleine RNA-Viren mit linearem, einzelsträngigem RNA-Genom positiver Polarität, die nur vier Proteine kodieren. Alle Phagen dieser Familie benötigen bakterielle Pili, um sich an die Wirtszelle (Bakterienzelle) zu binden und diese zu infizieren.[6]
Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Viren aus der bisherigen Klasse Allassoviricetes in eine neue Klasse Leviviricetes zu verschieben.[7] Dem hat das ICTV in der Ausgabe 36 seiner Master Species List (MSL) 2021 entsprochen, und dabei gleichzeitig die Ordnung (von Levivirales zu Norzivirales) und die Familie (von Leviviridae zu Fersviridae) umbenannt. Gleichzeitig hat sich die Anzahl der Gattungen von zwei auf 185 erhöht.[3]
Systematik
Äußere Systematik
Die Familie ist Mitglied der Ordnung Norzivirales (früher Levivirales). Die meisten Vertreter dieser Ordnung wurden per Metagenomik gefunden.[8] Zu dieser gehören die folgenden Familien:[3]
- Familie Atkinsviridae
- Familie Duinviridae
- Familie Fiersviridae (veraltet Leviviridae)
- Familie Solspiviridae
Innere Systematik
Die Familie hat mit ICTV Stand Juni 2021 einhundertfünfundachzig (185) Gattungen (Genera). Diese sind – mit einer Auswahl an Arten (Spezies):[3]
- Familie Fiersviridae (veraltet Leviviridae)
- Genus Adahivirus
- Genus Aldhiuvirus
- Genus Amubhivirus
- Genus Andhasavirus
- Genus Andhaxevirus
- Genus Anedhivirus
- Genus Apukhovirus
- Genus Ashucavirus
- Genus Bahscuvirus
- Genus Bathrivirus
- Genus Behevivirus
- Genus Behlfluvirus
- Genus Bertavirus
- Genus Bihdovirus
- Genus Bisdanovirus
- Genus Blafavirus
- Genus Bohnovirus
- Genus Bohwovirus
- Genus Boloprevirus
- Genus Boschuvirus
- Genus Breudwovirus
- Genus Brudgevirus
- Genus Buhdavirus
- Genus Cahdavirus
- Genus Cahrpivirus
- Genus Caloevirus
- Genus Cauhldivirus
- Genus Cehakivirus
- Genus Chaedoavirus
- Genus Chahsmivirus
- Genus Chihyovirus
- Genus Chobevirus
- Genus Choctavirus
- Genus Cintrevirus
- Genus Condavirus
- Genus Creshivirus
- Genus Cunavirus
- Genus Dahmuvirus
- Genus Darnbovirus
- Genus Decadevirus
- Genus Dehcevirus
- Genus Denfovirus
- Genus Depandovirus
- Genus Dihsdivirus
- Genus Dohlivirus
- Genus Dosmizivirus
- Genus Duhcivirus
- Genus Emesvirus (früher Levivirus)[9]
- Spezies Emesvirus japonicum (veraltet: Escherichia virus BZ13)
- Spezies Emesvirus zinderi (veraltet Escherichia virus MS2, Enterobakteriophage MS2, Coliphage MS2)
- Spezies Emesvirus piscicola
- Genus Empivirus
- Genus Fagihyuvirus
- Genus Febihevirus
- Genus Fiyodovirus
- Genus Gahlinevirus
- Genus Gahlovirus
- Genus Garovuvirus
- Genus Gehnevirus
- Genus Glincaevirus
- Genus Glyciruvirus
- Genus Gmuhndevirus
- Genus Gorodievirus
- Genus Grendvuvirus
- Genus Gunawavirus
- Genus Hagavirus
- Genus Hahdsevirus
- Genus Halcalevirus
- Genus Hihdivirus
- Genus Hukohnovirus
- Genus Icumivirus
- Genus Ideskevirus
- Genus Imeberivirus
- Genus Ineyimevirus
- Genus Iruqauvirus
- Genus Ishugivirus
- Genus Jiesduavirus
- Genus Johnovirus
- Genus Jupbevirus
- Genus Kahfsdivirus
- Genus Keghovirus
- Genus Kehmevirus
- Genus Kemicevirus
- Genus Kenamavirus
- Genus Kihryuvirus
- Genus Kirnavirus
- Genus Kiwsmaevirus
- Genus Konkivirus
- Genus Kowinovirus
- Genus Kuhshuvirus
- Genus Lohmavirus
- Genus Loslovirus
- Genus Lulohlevirus
- Genus Luthavirus
- Genus Mahqeavirus
- Genus Mahraivirus
- Genus Manohtivirus
- Genus Manrohovirus
- Genus Martavirus
- Genus Meblowovirus
- Genus Mehraxmevirus
- Genus Mekintivirus
- Genus Methovirus
- Genus Mihkrovirus
- Genus Mintuvirus
- Genus Monamovirus
- Genus Mucrahivirus
- Genus Muyegivirus
- Genus Nadsecevirus
- Genus Nahjiuvirus
- Genus Nahrudavirus
- Genus Nahsuvirus
- Genus Niankuvirus
- Genus Nihucivirus
- Genus Niuhvovirus
- Genus Noehsivirus
- Genus Nuihimevirus
- Genus Oceshuvirus
- Genus Olmsdivirus
- Genus Omohevirus
- Genus Onohmuvirus
- Genus Opdykovirus
- Genus Osigowavirus
- Genus Owenocuvirus
- Genus Oxychlovirus
- Genus Palsdevirus
- Genus Paysduvirus
- Genus Pehohrivirus
- Genus Pehsaduvirus
- Genus Pepevirus
- Genus Perrunavirus
- Genus Philtcovirus
- Genus Phobpsivirus
- Genus Phulivirus
- Genus Piponevirus
- Genus Pipunevirus
- Genus Pohlevirus
- Genus Pohtamavirus
- Genus Poncivirus
- Genus Psehatovirus
- Genus Psimevirus
- Genus Pudlivirus
- Genus Qubevirus (früher Allolevivirus)[10]
- Spezies Qubevirus durum (veraltet Escherichia virus Qbeta, Enterobakteriophage Qbeta, Coliphage Qβ)
- Spezies Qubevirus faecium (veraltet Escherichia virus FI)
- Genus Radbaivirus
- Genus Rehihmevirus
- Genus Rehudzovirus
- Genus Rusvolovirus
- Genus Scuadavirus
- Genus Sehcovirus
- Genus Sehpovirus
- Genus Seybrovirus
- Genus Shebanavirus
- Genus Shihovirus
- Genus Sholavirus
- Genus Shomudavirus
- Genus Shuravirus
- Genus Sincthavirus
- Genus Skhembuvirus
- Genus Smudhfivirus
- Genus Soetuvirus
- Genus Sphonivirus
- Genus Stehlmavirus
- Genus Swihdzovirus
- Genus Tahluvirus
- Genus Tapikevirus
- Genus Teciucevirus
- Genus Tehdravirus
- Genus Tehnexuvirus
- Genus Thidevirus
- Genus Thiwvovirus
- Genus Thiyevirus
- Genus Thobivirus
- Genus Ticahravirus
- Genus Tohvovirus
- Genus Trucevirus
- Genus Ureyisuvirus
- Genus Ushumevirus
- Genus Vinehtivirus
- Genus Vohsuavirus
- Genus Wahtavirus
- Genus Whietlevirus
- Genus Whilavirus
- Genus Wohudhevirus
- Genus Wyahnevirus
- Genus Yahnavirus
- Genus Yemegivirus
- Genus Yohcadevirus
- Genus Yuhrihovirus
Aufbau
(a) Enterobacteriaphage MS2 (Gattung Levivirus)
(b) Enterobacteriaphage Qß (Gattung Allolevivirus)
Die Viruspartikel (Virionen) der Leviviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischer oder sphärischer Geometri und mit Triangulationszahl (Symmetrie) T=3. Der Durchmesser beträgt etwa 26 nm. Das Genom ist linear und nicht segmentiert mit einer Größe von etwa 4000 Nukleotidbasen. Es kodiert für 4 Proteine.[4]
Wirkungsweise
Nach Eintritt die Wirtszelle erfolgt die Replikation dem Modell für RNA-Viren positiver Polarität. Das Virus tritt durch Bakterienlyse aus der Wirtszelle aus.[4]
Die vier kodierten Proteine sind das Mantel- oder Hüllprotein (für das Kapsid), die Replikase, das Reifungsprotein (A-Protein) und das Lyse-Protein, die zugehörigen Gene heißen cp, rep, mat und lys.[6]
Einzelnachweise
- ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
- ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
- Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 19. Dezember 2018.
- ICTV: ICTV Master Species List 2018a v1. Abgerufen am 19. Dezember 2018.
- JP Bollback, JP Huelsenbeck: Phylogeny, genome evolution, and host specificity of single-stranded RNA bacteriophage (family Leviviridae).. In: Journal of Molecular Evolution. 52, Nr. 2, Februar 2001, S. 117–28. doi:10.1007/s002390010140. PMID 11231891.
- Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
- J. Callanan, S. R. Stockdale, E. M. Adriaenssens, J. H. Kuhn: Rename one class (Leviviricetes - formerly Allassoviricetes), rename one order (Norzivirales - formerly Levivirales), create one new order (Timlovirales), and expand the class to a total of six families, 420 genera and 883 species. In: Researchgate. Januar 2021. doi:10.13140/RG.2.2.25363.40481.
- SIB: Levivirus, auf: ViralZone
- SIB: Allolevivirus, auf: ViralZone