Dicistroviridae
Die Dicistroviridae sind eine Familie von RNA-Viren, die verschiedene Insektenarten infizieren. Die Dicistroviridae infizieren unter anderem Röhrenblattläuse (Aphididae), Fliegen, Zwergzikaden, Bienen, Ameisen und Seidenspinner.[3][4][5]
Dicistroviridae | ||||||||||||||
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Systematik | ||||||||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||
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Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||
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Aufbau
Virion
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Discistroviren besitzen ein unbehülltes ikosaedrisches Kapsid von etwa 30 nm Durchmesser mit der Triangulationszahl pseudo-3. Das Kapsid besteht aus vier Kapsidproteinen CP1–4, von denen CP1–3 an der Oberfläche des Kapsids liegen und CP4 an der Innenseite des Kapsids.[6]
Genom
![](../I/OPSR.Dic.Fig2.Dicistroviridae.v4.png.webp)
Dicistroviren besitzen ein Genom aus einem einzelsträngigen RNA-Molekül positiver Polarität, das am 5'-Ende das virale Protein VPg trägt und am 3'-Ende einen Poly-A-Schwanz. Der Name Dicistroviridae stammt vom dicistronischen Aufbau des Genoms, sie besitzen zwei nicht überlappende offene Leseraster. Einige Dicistroviren wurden ursprünglich zu den Picornaviren gezählt. Die Dicistroviren gehören zusammen mit weiteren Familien wie den Picornaviridae, den Iflaviridae und den Secoviridae (letztere beinhalten die früheren Familien Sequiviridae und Comoviridae)[7][8] zur Virusordnung Picornavirales, die Picornavirales werden ihrerseits zusammen mit weiteren Familien wie den Potyviridae und Totiviridae zur vorgeschlagenen Gruppe picornavirus-like superfamily vereint.[9] Diese Superfamilie (eigentlich Superordnung) besitzt die Reihenfolge der Gene im Genom Hel(Helicase)-Pro(Protease)-RdRp(RNA-Polymerase) und im zweiten offenen Leseraster CP1-CP4-CP2-CP3. Im Gegensatz zu den meisten anderen Vertretern der Superfamilie befinden sich die Kapsidproteine am 3'-Ende des Genoms und nur Dicistroviren und Comoviren besitzen zwei offene Leseraster.
Die Cripaviren besitzen jeweils eine IRES am 5'-Ende von beiden offenen Leserastern,[10] die als alternativer Translationsstartpunkt verwendet wird.[11][12] Über einen Leserastersprung entsteht beim Cricket paralysis virus aus dem ersten offenen Leseraster das Protein VP1A.
Proteine
Aus dem Genom wird aus jedem offenen Leseraster ein Polyprotein erzeugt, das durch Proteolyse in seine endgültigen Bestandteile gespalten wird.
Systematik
Innere Systematik
Die Familie Dicistroviridae besteht nach ICTV mit Stand November 2018 aus drei Gattungen (Genera):[13]
- Genus: Aparavirus
- Spezies: Akutes Bienenparalysevirus (englisch Acute bee paralysis virus, ABPV, Typusspezies)[14][15][16][17]
- Spezies: Israelisches Akute-Paralyse-Virus (Israelisches Akute-Bienenparalyse-Virus, en. Israeli acute paralysis virus, IAPV)[18]
- Spezies: Kaschmir-Bienen-Virus (englisch Kashmir bee virus, KBV)[19]
- Spezies: Mud crab virus (MCDV, Mud crab dicistrovirus-1, befällt Schwimmcrabben der Gattung Scylla)[20]
- Spezies: Solenopsis invicta virus 1 (SINV-1) – ein Feuerameisenvirus, Spezies Solenopsis invicta
- Spezies: Taurasyndromvirus (englisch Taura syndrome virus, TSV)
- Genus Cripavirus (früher Cricket paralysis-like viruses):
- Genus Triatovirus:
- Spezies: Triatoma-Virus (englisch Triatoma virus, TrV, Typusspezies, befällt Raubwanzen der Gattung Triatoma in der Unterfamilie Triatominae)
- Spezies: Schwarzes Königinnenzellvirus (englisch Black queen cell virus, BQCV) – ein Honigbienenvirus
- Spezies: Himetobi P virus (HiPV)
- Spezies: Homalodisca coagulata virus 1 (HoCV-1)
- Spezies: Plautia stali intestine virus (PSIV)
- „Big Sioux River virus“ (BSRV)[14]
- Andere vorgeschlagene Spezies (Auswahl):
Weitere Vorschläge finden sich bei Wamonje et al. (2017).[27]
Äußere Systematik
Das ICTV hat mit der Master species List (MSL) #35 vom März 2020 die Dicistroviridae der Ordnung Picornavirales zugeordnet.[28] Ein Kladogramm findet sich dort unter Picornavirales §ICTV Master Species List #35.
Literatur
- Y. P. Chen et al.: Family Dicistroviridae. In: A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012. S. 840–842 ISBN 978-0-12-384684-6.
- D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin, (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.
Weblinks
- MeSH Dicistroviridae
- Dicistroviridae. ViralZone, Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
- Index of Viruses – Dicistroviridae. In: C. Büchen-Osmond (Hrsg.): ICTVdB - The Universal Virus Database, version 4. Columbia University, New York 2009. ncbi.nlm.nih.gov.
Einzelnachweise
- ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
- ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterovirus C, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- LE Hunnicutt, WB Hunter, RD Cave, CA Powell, JJ Mozoruk: Genome sequence and molecular characterization of Homalodisca coagulata virus-1, a novel virus discovered in the glassy-winged sharpshooter (Hemiptera: Cicadellidae). In: Virology, 2006, 350, S. 67-78.
- J. R. de Miranda, G. Cordoni, G. Budge: The Acute bee paralysis virus-Kashmir bee virus-Israeli acute paralysis virus complex. In: Journal of Invertebrate Pathology,2010, 103, S. S30-S47
- SM Valles, CA Strong, PM Dang, WB Hunter, RM Pereira, DH Oi, AM Shapiro, DF Williams: A picorna-like virus from the red imported fire ant, Solenopsis invicta: initial discovery, genome sequence, and characterization. In: Virology, 2004, 328, S. 151-157.
- WB Hunter, CS Katsar, JX Chaparro: Molecular analysis of capsid protein of Homalodisca coagulata virus-1, a new leafhopper-infecting virus from the glassy-winged sharpshooter, Homalodisca coagulata. In: Journal of Insect Science, 2006, 6, S. 31
- ICTV: Reports: Picornavirales > Secoviridae, April 2017
- Siehe Picornavirales §Äußere Systematik
- Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity. In: Virology, Mai 2015, S. 479–480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
- Y Kanamori, Nakashima N: A tertiary structure model of the internal ribosome entry site (IRES) for methionine-independent initiation of translation. In: RNA. 7, Nr. 2, 2001, S. 266–274. doi:10.1017/S1355838201001741. PMID 11233983. PMC 1370084 (freier Volltext).
- Malys N, McCarthy JEG: Translation initiation: variations in the mechanism can be anticipated. In: Cellular and Molecular Life Sciences. 68, Nr. 6, 2010, S. 991–1003. doi:10.1007/s00018-010-0588-z. PMID 21076851.
- M. I. Hertz, S. R. Thompson: Mechanism of translation initiation by Dicistroviridae IGR IRESs. In: Virology. Band 411, Nummer 2, März 2011, S. 355–361, ISSN 1096-0341. doi:10.1016/j.virol.2011.01.005. PMID 21284991. PMC 3076094 (freier Volltext).
- ICTV: Master Species List 2018a v1 MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)
- Laura M. Brutscher, Katie F. Daughenbaugh, Michelle L. Flenniken: Antiviral Defense Mechanisms in Honey Bees, in: Curr Opin Insect Sci. Nr. 10, August 2015, S. 71–82, doi:10.1016/j.cois.2015.04.016, PMC 4530548 (freier Volltext), PMID 26273564
- Benjamin Dainat, Anton Imdorf, Jean-Daniel Charrière, Peter Neumann: Bienenviren (Teil 2). (PDF) In: Schweizerische Bienen-Zeitung, 5/2008, Zentrum für Bienenforschung, Agroscope Liebefeld-Posieux ALP, 3003 Bern
- Annegret Wagner: Tote Bienen: Vergiftung oder Virusinfektion? In: Tierarzt, 15. Dezember 2019
- Bienenparalyse Viren. In: Die Honigmacher, Deutscher Imkerbund e. V., Anfängerkurs. Stand: 5. Oktober 2015
- Elke Genersch: Bienenviren, ein kurzer Überblick. (PDF; 463 kB) Länderinstitut für Bienenkunde Hohen Neuendorf e. V.; abgerufen am 28. Januar 2021
- NCBI: Kashmir bee virus (species)
- Y. Gao et al.: Cryo-EM structures of novel viruses from mud crab Scylla Paramamosain with multiple infections. In: J Virol., 16. Januar 2019, pii: JVI.02255-18. doi:10.1128/JVI.02255-18, PMID 30651355
- Cricket paralysis virus. ICTV 8th Report, Virusworld
- Picornaviren. In: Lexikon der Biologie auf Spektrum.de
- S. Liu, D. Vijayendran, J. Carrillo-Tripp, W. A. Miller, B. C. Bonning: Analysis of new aphid lethal paralysis virus (ALPV) isolates suggests evolution of two ALPV species. In: J Gen Virol., 95(Pt 12), Dezember 2014, S. 2809–2819, doi:10.1099/vir.0.069765-0, PMID 25170050
- Norman Carreck, Brenda V Ball, Stephen J Martin: The epidemiology of cloudy wing virus infections in honey bee colonies in the UK. In: Journal of Apicultural Research, 49(1), S. 66–71, Januar 2010, researchgate.net doi:10.3896/IBRA.1.49.1.09
- Hélène Berthoud, Anton Imdorf, Jean-Daniel Charrière, Monika Haueter, Peter Fluri: Bienenviren – ein wenig bekanntes Gebiet. (PDF; 132 kB) Zentrum für Bienenforschung, Agroscope Liebefeld-Posieux, Liebefeld / Bern 2005
- NCBI: Acheta domesticus virus (species)
- Francis O. Wamonje et al.: Viral metagenomics of aphids present in bean and maize plots on mixed-use farms in Kenya reveals the presence of three dicistroviruses including a novel Big Sioux River virus-like dicistrovirus. In: Virol J, 2. Oktober 2017, Band 14, Nr. 1, S. 188, doi:10.1186/s12985-017-0854-x, PMID 28969654, PMC 5625602 (freier Volltext)
- ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)