Natriumborat-Puffer

Natriumborat-Puffer (SB-Puffer) ist ein Elektrophoresepuffer, der in der Biochemie und Molekularbiologie im Zuge einer Agarose-Gelelektrophorese zur Trennung von Nukleinsäuren wie DNA oder RNA verwendet wird.[1][2][3]

Eigenschaften

Der SB-Puffer ist aus Natriumhydroxid und Borsäure zusammengesetzt (1–10 mM, pH 8.0) und besitzt im Vergleich zu den alternativen Puffern (TAE-Puffer, TBE-Puffer, TPE-Puffer) eine niedrigere Ionenstärke und daher eine niedrigere elektrische Leitfähigkeit, übertroffen nur durch den Lithiumborat-Puffer. Dies erlaubt eine höhere angelegte elektrische Spannung (5–35 V/cm Gellänge gegenüber 5–10 V/cm) und daher eine höhere Wanderungsgeschwindigkeit der Nukleinsäuren ohne Erhitzung des Agarosegels. Dadurch verkürzt sich die zur elektrophoretischen Trennung benötigte Zeit.

Weblinks

Natriumborat als Elektrophoresepuffer

Einzelnachweise

Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: Sodium boric acid: a tris-free, cooler conductive medium for DNA electrophoresis. In: BioTechniques. Bd. 36, Nr. 2, 2004, ISSN 0736-6205, S. 214–215, PMID 14989083 (PDF; 155 kB) (Memento des Originals vom 24. Juli 2011 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2.
Jonathan R. Brody, Eric S. Calhoun, Eike Gallmeier, Talisa D. Creavalle, Scott E. Kern (2004): Ultra-fast high-resolution agarose electrophoresis of DNA and RNA using low-molarity conductive media. (Memento des Originals vom 14. August 2017 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2 In: BioTechniques. Bd. 37, Nr. 4, 2004, S. 598–602, PMID 15517972 (PDF; 198 kB)@1@2 (Seite nicht mehr abrufbar, Suche in Webarchiven) Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. .
Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis. In: Analytical Biochemistry. Bd. 333, Nr. 1, 2004, S. 1–13, PMID 15351274 (PDF; 1,14 MB).

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[1] Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: Sodium boric acid: a tris-free, cooler conductive medium for DNA electrophoresis. In: BioTechniques. Bd. 36, Nr. 2, 2004, ISSN 0736-6205, S. 214–215, PMID 14989083 (PDF; 155 kB) (Memento des Originals vom 24. Juli 2011 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2.

[2] Jonathan R. Brody, Eric S. Calhoun, Eike Gallmeier, Talisa D. Creavalle, Scott E. Kern (2004): Ultra-fast high-resolution agarose electrophoresis of DNA and RNA using low-molarity conductive media. (Memento des Originals vom 14. August 2017 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2 In: BioTechniques. Bd. 37, Nr. 4, 2004, S. 598–602, PMID 15517972 (PDF; 198 kB)@1@2 (Seite nicht mehr abrufbar, Suche in Webarchiven) Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. .

[3] Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis. In: Analytical Biochemistry. Bd. 333, Nr. 1, 2004, S. 1–13, PMID 15351274 (PDF; 1,14 MB).