Indivirus

„Indivirus “ (IndV , auch ILV) ist eine vorgeschlagene Gattung von Riesenviren im Phylum Nucleocytoviricota (früher Nucleocytoplasmic large DNA viruses, NCLDV), Familie Mimiviridae mit nur einer Spezies, „Indivirus ILV1“.[2][3] Wie alle diese Riesenviren haben sie ein Genom aus einer doppelsträngigen DNA (dsDNA). Die Gattung wurde bei der Analyse von Metagenomproben aus Bodensedimenten von Ablagerungen in der Kläranlage in Klosterneuburg nahe bei Wien, Österreich, gefunden. Zusammen mit „Indivirus“ wurden dort von Schulz et al. 2017 drei weitere Virusgattungen identifiziert, „Klosneuvirus“, „Catovirus“ und „Hokovirus“, die allesamt als Klosneuviren (vorgeschlagene Unterfamilie „Klosneuvirinae“) bezeichnet werden.[4]

„Indivirus“
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[1]
Reich: Bamfordvirae[1]
Phylum: Nucleocytoviricota[1]
Klasse: Megaviricetes[1]
Ordnung: Imitervirales[1]
Familie: Mimiviridae
Unterfamilie: „Klosneuvirinae“?
Gattung: „Indivirus“
Art: „Indivirus ILV1“
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
„Indivirus“
Kurzbezeichnung
IndV / ILV
Links
NCBI Taxonomy: 1977632

Genom

„Indivirus“ h​at ein Genom v​on 861.511 Basenpaaren (bp) u​nd kodiert vorhergesagt 744 Proteine (bei 660 Genfamilien), d​as ist d​as kleinste Genom u​nter den genannten Klosneuviren. Der GC-Gehalt beträgt niedrige 26,6 %.[4][5]

Wirte

Die Metagenomanalyse d​er ribosomalen 18S-rRNA zeigte weiter, d​ass ihre Wirte einfachen Cercozoa (zumindest) nahestehen.[4]

Systematik

Mit Stand April 2020 ist „Indivirus“ noch nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) registriert (Master Species List #35).[1][6] Das National Center for Biotechnology Information (NCBI) sieht die Gattung Indivirus mit der Spezies „Indivirus ILV1“ in der Familie der Mimiviridae.[2]

Während d​ie Zugehörigkeit a​ller vier i​n Klosterneuburg gefundenen Virusgattungen z​u den Mimiviridae unbestritten ist, w​ird die genaue Topologie d​es Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb dieser Familie derzeit n​och diskutiert. Meist werden s​ie wie b​ei Schulz et al. (2017) i​n eine vorgeschlagene Unterfamilie „Klosneuvirinae“ gestellt.[4]

Einige Autoren (CNS 2018) sehen die Klosneuviren in naher Verwandtschaft mit dem Cafeteria-roenbergensis-Virus (CroV) und dem „Bodo-saltans-Virus“ (BsV) und fassen diese in einer vorläufige Unterfamilie namens „Aquavirinae“.[7] Ein weiterer Vorschlag besteht darin, alle zusammen mit den Mimiviren (mit dem eigentlichen Mimivirus APMV und „Megavirus“) in eine größere Unterfamilie „Megavirinae“ zu stellen.[8]

Während das NCBI das „Bodo-saltans-Virus“ (BsV) als eigene Spezies in der Gattung „Klosneuvirus“ sieht,[9] schlagen Disa Bäckström et al. (2019), Fig. 3, eine Systematik der Klosneuviren mit dem „Catovirus“ als nächsten Verwandten von BsV unter den vier ursprünglichen Klosneuviren vor.[10] Kladogramme zur inneren Systematik der Klosneuviren finden sich unter Klosneuvirus §Systematik.

Einzelnachweise
  1. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. NCBI: Indivirus (Gattung), Zugriffsdatum: 20. August 2019
  3. NCBI: Indivirus ILV1 (Species), Zugriffsdatum: 20. August 2019
  4. Frederik Schulz, Natalya Yutin, Natalia N. Ivanova, Davi R. Ortega, Tae Kwon Lee, Julia Vierheilig, Holger Daims, Matthias Horn, Michael Wagner: Giant viruses with an expanded complement of translation system components. In: Science. 356, Nr. 6333, 7. April 2017, ISSN 0036-8075, S. 82–85. doi:10.1126/science.aal4657.
  5. David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)
  6. ICTV: Master Species List 2018b.v2. Abgerufen am 2. August 2019.
  7. Centre national de la recherche scientifique (CNS): List of the main “giant” viruses known as of today, Université Aix Marseille, 18. April 2018
  8. C.M. Deeg, E.C.T. Chow, C.A. Suttle: The kinetoplastid-infecting Bodo saltans virus (BsV), a window into the most abundant giant viruses in the sea. In: eLife. 7, 2018, S. e33014. doi:10.7554/eLife.33014.
  9. NCBI: Bodo saltans virus (Spezies), Zugriffsdatum: 2. August 2019
  10. Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema; Richard P. Novick (Hrsg.): Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism, in: mBio Vol. 10 Nr. 2 2019, doi:10.1128/mBio.02497-18
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