Finnlakeviridae

Finnlakeviridae i​st die Bezeichnung für e​ine Familie v​on Viren, d​ie noch keinem höheren taxonomischen Rang zugeordnet ist. Die Familie enthält e​ine einzige Gattung, Finnlakevirus, u​nd die e​ine einzige Spezies (Art), Flavobacterium v​irus FLiP. Die natürlichen Wirte s​ind gramnegative Bakterien, d​aher werden d​ie Finnlakeviridae nicht-taxonomisch a​ls Bakteriophage klassifiziert.[1][3]

Finnlakeviridae

TEM-Aufnahme v​on Virionen d​er Spezies Flavobacterium p​hage FLiP. Balken 100 nm.[1]

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: nicht klassifiziert[2]
Reich: nicht klassifiziert[2]
Phylum: nicht klassifiziert[2]
Klasse: nicht klassifiziert[2]
Ordnung: nicht klassifiziert[2]
Familie: Finnlakeviridae[2]
Gattung: Finnlakevirus
Taxonomische Merkmale
Genom: ssDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 2
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: behüllt?
Wissenschaftlicher Name
Finnlakeviridae
Links
NCBI Taxonomy: 2732901 (Familie),
2733303 (Gattung)
ICTV Taxon History: 201907846 (Familie),
201907847 (Gattung)
Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions von Flavobacterium phage FLiP.[1]
Finnlakeviridae-Partikel im Querschnitt (Schema)

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).[4][3]

Genom

Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.[1]

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).[3]

Einzelnachweise

  1. S. Mäntynen, E. Laanto, L. R. Sundberg, M. M. Poranen, H. M. Oksanen: ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae, in: The Journal of General Virology, Band 101, Nr. 9, September 2020, S. 894–895, doi:10.1099/jgv.0.001488, PMID 32840474, ICTV.
  2. ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ICTV Report Finnlakeviridae.
  4. NCBI: Pseudoalteromonas virus PM2 (species)
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