Mihaela Zavolan

Mihaela Zavolan (* 23. April 1968 i​n Timișoara) i​st eine rumänische Systembiologin u​nd Professorin a​m Biozentrum d​er Universität Basel.

Mihaela Zavolan (2011)

Leben

Mihaela Zavolan studierte Medizin a​n der Medizinischen u​nd Pharmazeutischen Universität i​n Timișoara, Rumänien. Anschliessend promovierte s​ie in Computer Science a​n der University o​f New Mexico i​n Albuquerque, USA. In d​en USA, forschte Zavolan zwischen 1993 u​nd 2003 a​uch am Santa Fe Institute i​n Santa Fe, i​m Los Alamos National Laboratory i​n Los Alamos, s​owie an d​er Rockefeller University i​n New York. 2003 w​urde Mihaela Zavolan Professorin für Computational a​nd Systems Biology a​m Biozentrum d​er Universität Basel[1] u​nd Gruppenleiterin a​m Swiss Institute o​f Bioinformatics (SIB).[2]

Wirken

Zavolan erforscht sogenannte microRNAs (miRNAs).[3] Diese 22 Nukleotid langen RNA-Moleküle regulieren die Expression proteinkodierender Gene und steuern so Zelldifferenzierung, Stoffwechsel und Immunantwort der Zellen. Durch die Entwicklung von Hochdurchsatzmethoden kombiniert mit Computeranalysen entdeckte Zavolan zahlreiche miRNAs in verschiedene Organismen von Viren bis zum Menschen.[4] Sie entwickelte Computerprogramme zur exakten Vorhersage von miRNA-Genen im Genom und von Ziel-mRNAs. Darüber hinaus arbeitete Michaela Zavolan an der Entwicklung der CLIP-Methode (Crosslinking and Immunoprecipitation) zur Lokalisierung der Bindungsstellen zwischen Boten-RNAs (mRNAs) und Regulationsproteinen (RBP) mit.[5] Zudem konzipierte sie ein biophysikalisches Modell, mit der sich die Wechselwirkung und Bindungsstärke zwischen microRNAs und mRNAs vorhersagen lässt.[6]

Auszeichnungen

Publikationen (Auswahl)
  • M. Khorshid, J. Hausser, M. Zavolan, E. van Nimwegen: A biophysical miRNA-mRNA interaction model infers canonical and noncanonical targets. In: Nat Methods. 10(3), Mar 2013, S. 253–255. doi:10.1038/nmeth.2341. Epub 2013 Jan 20. PMID 23334102.
  • S. Kishore, L. Jaskiewicz, L. Burger, J. Hausser, M. Khorshid, M. Zavolan: A quantitative analysis of CLIP methods for identifying binding sites of RNA-binding proteins. In: Nat Methods. 8(7), 15. Mai 2011, S. 559–564. doi:10.1038/nmeth.1608. PMID 21572407.
  • P. Landgraf, M. Rusu, R. Sheridan, A. Sewer, N. Iovino, A. Aravin, S. Pfeffer, A. Rice, A. O. Kamphorst, M. Landthaler, C. Lin, N. D. Socci, L. Hermida, V. Fulci, S. Chiaretti, R. Foà, J. Schliwka, U. Fuchs, A. Novosel, R. U. Müller, B. Schermer, U. Bissels, J. Inman, Q. Phan, M. Chien, D. B. Weir, R. Choksi, G. De Vita, D. Frezzetti, H. I. Trompeter, V. Hornung, G. Teng, G. Hartmann, M. Palkovits, R. Di Lauro, P. Wernet, G. Macino, C. E. Rogler, J. W. Nagle, J. Ju, F. N. Papavasiliou, T. Benzing, P. Lichter, W. Tam, M. J. Brownstein, A. Bosio, A. Borkhardt, J. J. Russo, C. Sander, M. Zavolan, T. Tuschl: A mammalian microRNA expression atlas based on small RNA library sequencing. In: Cell. 129(7), 29. Juni 2007, S. 1401–1414. PMID 17604727; PMC 2681231 (freier Volltext).
  • D. Gaidatzis, E. van Nimwegen, J. Hausser, M. Zavolan: Inference of miRNA targets using evolutionary conservation and pathway analysis. In: BMC Bioinformatics. 8, 1. März 2007, S. 69. Erratum in: BMC Bioinformatics. 8(1), 12. Juli 2007, S. 248. PMID 17331257; PMC 1838429 (freier Volltext).
  • A. Aravin, D. Gaidatzis, S. Pfeffer, M. Lagos-Quintana, P. Landgraf, N. Iovino, P. Morris, M. J. Brownstein, S. Kuramochi-Miyagawa, T. Nakano, M. Chien, J. J. Russo, J. Ju, R. Sheridan, C. Sander, M. Zavolan, T. Tuschl: A novel class of small RNAs bind to MILI protein in mouse testes. In: Nature. 442(7099), 13. Juli 2006, S. 203–207. Epub 2006 Jun 4. PMID 16751777.

Einzelnachweise
  1. Curriculum Vitae biozentrum.unibas.ch, abgerufen am 27. Januar 2014.
  2. SIB Group M. Zavolan isb-sib.ch, abgerufen am 27. Januar 2014.
  3. Research Group Mihaela Zavolan eurasnet.info, abgerufen am 27. Januar 2014.
  4. Neues biophysikalisches Modell prognostiziert Regulation durch microRNAs@1@2Vorlage:Toter Link/www.unibas.ch (Seite nicht mehr abrufbar, Suche in Webarchiven)  Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis. unibas.ch, abgerufen am 27. Januar 2014.
  5. A quantitative analysis of CliP methods for identifying binding sites of rnA-binding proteins nature.com, abgerufen am 27. Januar 2014.
  6. A biophysical miRNA-mRNA interaction model infers canonical and noncanonical targets nature.com, abgerufen am 27. Januar 2014.
  7. ERC Starting Grant für Mihaela Zavolan biozentrum.unibas.ch, abgerufen am 27. Januar 2014.
  8. Mitglied der Academia Europaea ae-info.org, abgerufen 4. September 2014.
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