Corynephagen
Als Corynephagen werden informell (nicht-taxonomisch) Viren bezeichnet, deren spezifischer Wirt zur Bakterien-Gattung der Corynebacterium (Corynebakterien) gehört. Da diese Wirtsgattung Mitglied der Klasse Actinobacteria (Aktinobakterien) ist, werden diese Viren allgemeiner als Aktinobakteriophagen oder ganz allgemein als Bakteriophagen (kurz Phagen) klassifiziert[1] und auch als Corynebakteriophagen bezeichnet.
Alle zur Zeit (Stand 20. Februar 2021) durch das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) offiziell bestätigten oder nach National Center for Biotechnology Information (NCBI) gelistet vorgeschlagenen Corynephagen gehören zur Familie der Siphoviridae in der Ordnung Caudovirales.[2] Speziell werden Viren, deren Wirt die Bakterienart Corynebacterium diphtheriae ist, sollten sie sich taxonomisch als eine Klade (monophyletisch) erweisen, per Vorschlag als Spezies Corynebacterium diphtheriae virus[3] bezeichnet.
Die Corynephagen β und ω gehören per Vorschlag zur Gattung Lambdavirus, deren Typusspezies das lange bekannte Escherichia-Virus Lambda mit dem Lambda-Phagen (Phage λ) ist. Für diese Gattung gibt es einen Vorschlag, sie in eine Unterfamilie mit der vorläufigen Bezeichnung Lambda-Supergruppe (en. λ supergroup) innerhalb der Siphoviridae aufzunehmen.[4]
Corynephage β[5] (kurz β-Phage[6][7]) macht an sich ungefährliche Stämme von Corynebacterium diphtheriae toxisch (d. h. ist toxigen), indem es das Gen tox für das Diphtherietoxin (DT) trägt.[8][9][10][11][7][6]
Dazu kann der Phage sein Genom in das Bakterium als Prophage integrieren, und derartige Bakterienstämme zu Erregern der Diphtherie machen. Von dem Phagen wurden mindestens die Subtypen beta c und beta vir identifiziert.[8][12]
Toxigen ist auch Corynebacteriophage omega tox+, der sich von beta tox+ nur in drei Regionen des Genoms unterscheidet.[13]
Systematik
Mit Stand 20. Februar 2021 gehören alle vom ICTV bestätigten sowie die nach NCBI vorgeschlagenen Corynephagen der Familie Siphoviridae an:
Corynephagen (kein Taxon)
- Familie Siphoviridae
- Unterfamilie Lambda-Supergruppe (en. λ supergroup, vorgeschlagen)[4]
- Gattung Lambdavirus – Die Corynephagen dieser Gattung bilden möglicherweise eine Spezies Corynebacterium diphtheriae virus[3]
- Spezies Corynebacterium-Phage beta (en. Corynebacterium phage beta, alias Corynephage beta, Corynephage β)
- Spezies Corynebacterium-Phage omega (en. Corynebacterium phage omega, alias Corynephage omega, Corynephage ω)
- Corynephage omega c (alias Corynephage ωc)[12]
- Unterfamilie nicht bestimmt:
- Gattung Ceetrepovirus
- Spezies Corynebacterium-Virus C3PO (englisch Corynebacterium virus C3PO)
- Corynebacterium-Phage C3PO
- Spezies Corynebacterium-Virus Darwin (en. Corynebacterium virus Darwin)
- Corynebacterium-Phage Darwin
- Spezies Corynebacterium-Virus Zion (en. Corynebacterium virus Zion)
- Corynebacterium-Phage Zion
- Spezies Corynebacterium-Phage Cruella (en. Corynebacterium phage Cruella)
- Spezies Corynebacterium-Phage Kimchi1738 (en. Corynebacterium phage Kimchi1738)
- Spezies Corynebacterium-Phage PeteyPab (en. Corynebacterium phage PeteyPab)
- Spezies Corynebacterium-Phage PotatoChip (en. Corynebacterium phage PotatoChip)
- Spezies Corynebacterium-Phage Stickynote (en. Corynebacterium phage Stickynote)
- Gattung Chunghsingvirus
- Spezies Corynebacterium-Virus P1201 (en. Corynebacterium virus P1201)
- Corynebacterium-Phage P1201
- Gattung Ikedavirus
- Spezies Corynebacterium-Virus phi673 (en. Corynebacterium virus phi673)
- Corynebacterium-Phage phi673
- Spezies Corynebacterium-Virus phi674 (en. Corynebacterium virus phi674)
- Corynebacterium-Phage phi674
- Gattung Juiceboxvirus
- Spezies Corynebacterium-Virus Juicebox (en. Corynebacterium virus Juicebox)
- Corynebacterium-Phage Juicebox
- Gattung Poushouvirus
- Spezies Corynebacterium-Virus Poushou (en. Corynebacterium virus Poushou)
- Corynebacterium-Phage Poushou
- Spezies Corynebacterium-Phage Colleen (en. Corynebacterium phage Colleen)
- Spezies Corynebacterium-Phage TouchMeNot (en. Corynebacterium phage TouchMeNot)
- Gattung Samwavirus
- Spezies Corynebacterium-Virus SamW (en. Corynebacterium virus SamW)
- Corynebacterium-Phage SamW
- Spezies Corynebacterium-Phage Adelaide (en. Corynebacterium phage Adelaide, ungleich Adelaide River virus alias Adelaide River ephemerovirus (Rhabdoviridae; Ephemerovirus))
- Spezies Corynebacterium-Phage Dina (en. Corynebacterium phage Dina)
- Spezies Corynebacterium-Phage Lederberg (en. Corynebacterium phage Lederberg, ungleich Lederbergvirus, Podoviridae)
- Spezies Corynebacterium-Phage StAB (en. Corynebacterium phage StAB)
- Spezies Corynebacterium-Phage Stiles (en. Corynebacterium phage Stiles)
- Spezies Corynebacterium-Phage Troy (en. Corynebacterium phage Troy)
- Gattung Sasvirus
- Spezies Corynebacterium-Virus BFK20 (en. Corynebacterium virus BFK20)
- Corynebacterium-Phage BFK20
- Gattung nicht zugewiesen
- Spezies Arthrobacter-Phage phi AAU2 (en. Arthrobacter phage phi AAU2, alias Corynebacterium-Phage phiAAU2, Bacteriophage AAU2, Bacteriophage FAAU2)
- Spezies Corynebacterium-Phage Bran (en. Corynebacterium phage Bran)
- Spezies Corynebacterium-Phage EmiRose (en. Corynebacterium phage EmiRose)
- Spezies Corynebacterium-Phage IME1320_01 (en. Corynebacterium phage IME1320_01)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-VI (en. Corynebacterium phage LGCM-VI)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V2 (en. Corynebacterium phage LGCM-V2)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V3 (en. Corynebacterium phage LGCM-V3)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V4 (en. Corynebacterium phage LGCM-V4)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V5 (en. Corynebacterium phage LGCM-V5)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V6 (en. Corynebacterium phage LGCM-V6)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V7 (en. Corynebacterium phage LGCM-V7)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V8 (en. Corynebacterium phage LGCM-V8)
- Spezies Corynebacterium-Phage LGCM-V9 (en. Corynebacterium phage LGCM-V9)
- Spezies Corynebacterium-Phage gamma (en. Corynebacterium phage gamma, alias Corynephage gamma, Corynephage γ, nicht toxigen)[13]
- Spezies Corynebacterium-Phage phi16 (alias Corynephage phi16, en. Corynebacterium phage phi16)
- Spezies Corynephage 304L
Siehe auch
- Mykobakteriophagen (eine andere durch ihre Wirtsgattung informell klassifizierte Gruppe von Aktinobakteriophagen)
Einzelnachweise
- PhagesDb: The Actinobacteriophage Database
- NCBI: Corynephages (list)
- NCBI: Corynebacterium diphtheriae phage/virus (species)
- Harald Brüssow, Frank Desiere: Comparative phage genomics and the evolution of Siphoviridae: insights from dairy phages. In: Mol Microbiol. 39, Nr. 2, 2001, S. 213–222. doi:10.1046/j.1365-2958.2001.02228.x, PMID 11136444, 21. Dezember 2001, Stichwort λ supergroup.
- NCBI: Corynephage beta (species)
- SIB: Modulation of host virulence by virus. Expasy: ViralZone
- SIB: Viral exotoxin. Expasy: ViralZone
- J. J. Costa, J. L. Michel, R. Rappuoli, J. R. Murphy: Restriction map of corynebacteriophages beta c and beta vir and physical localization of the diphtheria tox operon. In: Journal of Bacteriology. 148, Nr. 1, 1981, S. 124–130. doi:10.1128/JB.148.1.124-130.1981. PMID 6270058. PMC 216174 (freier Volltext). Der Titel wird auch Restriction map of Corynebacteriophages βc and βvir and physical localization of diptheria tox operon geschrieben, siehe Rappuoli (1985)
- Julie K. Segman (Hrsg.): Stedman's Medical Dictionary, 28th. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore, Maryland 2006, ISBN 978-0-7817-3390-8, S. 449.
- TABLE 1. Bacterial virulence properties altered by bacteriophages from P. L. Wagner, M. K. Waldor: Bacteriophage control of bacterial virulence. In: Infection and Immunity. 70, Nr. 8, August 2002, S. 3985–3993. doi:10.1128/IAI.70.8.3985-3993.2002. PMID 12117903. PMC 128183 (freier Volltext).
- L. P. Johnson, M. A. Tomai, P. M. Schlievert: Bacteriophage Involvement in Group A Streptococcal Pyrogenic Exotoxin A Production. In: Journal Of Bacteriology, Volume 166, No. 2, Mai 1986, S. 623–627
- J. L. Michel, R. Rappuoli, J. R. Murphy, and A. M. Pappenheimer Jr.: Restriction endonuclease map of the nontoxigenic corynephage γc and its relationship to the toxigenic corynephage βc. J. Virol. 42, 1982, S. 510–518, PMID 6283169, PMC 256877 (freier Volltext)
- R. Rappuoli, J. L. Michel, J. R. Murphy: Restriction endonuclease map of corynebacteriophage omega ctox+ isolated from the Park-Williams no. 8 strain of Corynebacterium diphtheriae, in: J Virol 45(2), Februar 1983, S. 524–530, doi:10.1128/JVI.45.2.524-530.1983, PMID 6300416, PMC 256445 (freier Volltext)
- R. Rappuoli, G. Ratti, M. Perugini, I. Marsili: Production of Large Quantities of Diphtheria Toxoid CRM45, in: Bio/Technology Band 3, S. 161–163, 1. Februar 1985, doi:10.1038/nbt0285-161