Affinitätselektrophorese

Die Affinitätselektrophorese umfasst i​n der Biochemie a​lle elektrophoretischen Verfahren, b​ei denen e​in verändertes Laufverhalten v​on Molekülen (z. B. v​on Proteinkomplexen o​der DNA-Protein-Komplexen) d​urch die Affinität zweier o​der mehrerer Moleküle zueinander erzeugt wird.[1] Aufgrund d​er veränderten Laufgeschwindigkeiten werden affinitätselektrophoretische Verfahren a​uch als electrophoretic s​hift assays bezeichnet.

Verfahren

Je n​ach beobachtetem Parameter e​iner Elektrophorese werden d​ie Anwendungen a​ls mobility s​hift electrophoresis (bei verfolgter Laufweite), charge s​hift electrophoresis (bei verfolgtem isoelektrischem Punkt) o​der affinity capillary electrophoresis (bei e​iner Kapillarelektrophorese) bezeichnet.

Affinitätselektrophoretische Verfahren z​um Nachweis v​on Protein-Protein-Interaktionen s​ind z. B. d​ie QPNC-PAGE, d​ie Clear-Native-PAGE, d​ie Blue-Native-PAGE o​der die SDS-PAGE n​ach einer Quervernetzung.

Die Interaktion v​on DNA m​it Proteinen k​ann durch e​inen Electrophoretic Mobility Shift Assay o​der eine Kapillarelektrophorese nachgewiesen werden.

Eine Bindung v​on Kohlenhydraten a​n Proteine (z. B. v​on Polysacchariden a​n Lektine) k​ann durch e​ine Lektin-Affinitätselektrophorese untersucht werden.[2]

Literatur
  • Erica A. Golemis, Peter D. Adams: Protein-protein interactions. A molecular cloning manual. 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 2005, ISBN 0-87969-723-7.
  • Friedrich Lottspeich, Joachim W. Engels (Hrsg.): Bioanalytik. 3., aktualisierte und erweiterte Auflage. Springer Spektrum, Berlin u. a. 2012, ISBN 978-3-8274-2942-1.

Einzelnachweise
  1. N. H. Heegaard, R. T. Kennedy: Identification, quantitation, and characterization of biomolecules by capillary electrophoretic analysis of binding interactions. In: Electrophoresis. Band 20, Nr. 15-16, Oktober 1999, S. 3122–3133, doi:10.1002/(SICI)1522-2683(19991001)20:15/16<3122::AID-ELPS3122>3.0.CO;2-M, PMID 10596820.
  2. Kazuaki Kakehi, Mitsuhiro Kinoshita: Capillary lectin-affinity electrophoresis for glycan analysis. In: Methods in molecular biology. Band 534, 2009, S. 93–105, doi:10.1007/978-1-59745-022-5_7, PMID 19277533.
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