1000-Genome-Projekt

Das 1000-Genome-Projekt ist ein internationales Projekt, in dem – wie im Januar 2008 bekanntgegeben wurde – geplant war, bis Ende 2011 die Genome von rund 2500 Menschen zu sequenzieren, um daraus einen detaillierten Katalog menschlicher genetischer Variationen zu erstellen, inklusive Einzelnukleotid-Polymorphismen, INDELs und strukturelle Variationen wie Kopienzahlvariationen.[1] Dies wäre die bislang bei weitem umfangreichste Erfassung menschlicher Genome. Um dieses Projekt zu realisieren, arbeiteten Institute vieler Länder zusammen, unter anderem in den USA, England, der Volksrepublik China und Deutschland. Die komplette Datenbank wird Wissenschaftlern weltweit kostenlos zur Verfügung gestellt und eine Bereicherung für alle Gebiete der Naturwissenschaften sein.[2]

Im Juni 2008 traten drei Unternehmen, die an der Entwicklung neuer Sequenziertechnologien beteiligt waren, dem Projekt bei.[3]

Im Dezember 2008 wurden die ersten vorläufigen Daten von vier Individuen als Teil eines Pilotprojekts veröffentlicht.[1] Im Oktober 2010 folgte die Publikation von Sequenzdaten ganzer Genome von 185 Individuen im Rahmen des Abschlusses des Pilotprojekts des 1000-Genome-Projekts.[4] Weiterhin erschien im Februar 2011 die Veröffentlichung einer bioinformatischen Analyse von genomischen Strukturvarianten (SVs) – inkl. Kopienzahlvariantionen (englisch CNVs) – durch die SV-Analysegruppe des 1000-Genome-Projekts.[5]

Im Oktober 2012 wurde bekannt, dass das Ziel erreicht wurde und die Erbgutdaten von mehr als 1.000 Menschen gelesen und veröffentlicht wurden.[6]

Weblinks

Homepage des 1000-Genome-Projekts
Sequenzierung von 1000 ausgesuchten Genen in 1000 Individuen im Berliner Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik
Analyse von genomischen Strukturvarianten, d. h. von CNVs und Inversionen, im Rahmen des 1000-Genome-Projekts am Europäischen Laboratorium für Molekularbiologie in Heidelberg

Einzelnachweise

http://www.1000genomes.org/
G. Spencer: International Consortium Announces the 1000 Genomes Project. National Human Genome Research Institute (NHGRI), 22. Januar 2008. (Website)
Geoff Spencer: Three Sequencing Companies Join 1000 Genomes Project. (PDF; 79 kB) In: www.1000genomes.org. National Human Genome Research Institute (NHGRI), 11. Juni 2008, abgerufen am 1. Juli 2013 (englisch).
1000 Genomes Project Consortium (2010). A map of human genome variation from population-scale sequencing. In: Nature. Bd. 467, S. 1061–1073. PMID 20981092
Mills, R.E. et al. (2011). Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing. In: Nature. Bd. 470, S. 59–65. PMID 21293372
Erbgut veröffentlicht. 1.000-Genom-Projekt hat Ziel erreicht: kma online (Memento vom 28. Februar 2013 im Internet Archive)

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[1000GP-1] ttp://www.1000genomes.org/

[2] G. Spencer: International Consortium Announces the 1000 Genomes Project. National Human Genome Research Institute (NHGRI), 22. Januar 2008. (Website)

[3] Geoff Spencer: Three Sequencing Companies Join 1000 Genomes Project. (PDF; 79 kB) In: www.1000genomes.org. National Human Genome Research Institute (NHGRI), 11. Juni 2008, abgerufen am 1. Juli 2013 (englisch).

[4] 1000 Genomes Project Consortium (2010). A map of human genome variation from population-scale sequencing. In: Nature. Bd. 467, S. 1061–1073. PMID 20981092

[Mills_2011-5] Mills, R.E. et al. (2011). Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing. In: Nature. Bd. 470, S. 59–65. PMID 21293372

[6] Erbgut veröffentlicht. 1.000-Genom-Projekt hat Ziel erreicht: kma online (Memento vom 28. Februar 2013 im Internet Archive)