Insight Segmentation and Registration Toolkit

Das Insight Segmentation a​nd Registration Toolkit (ITK) i​st eine Open-Source-C++-Programmbibliothek für d​ie Segmentierung u​nd Registrierung v​on Bildern.

ITK
Basisdaten
Entwickler National Library of Medicine, Kitware Inc. und diverse Universitäten
Aktuelle Version 5.1.1[1]
Betriebssystem Unix-Derivate (Linux, macOS), Windows
Programmiersprache C, C++, Python[2]
Kategorie Bildverarbeitung
Lizenz Apache 2.0 Lizenz[3]
deutschsprachig nein
www.itk.org

Allgemeines

Die Entwicklung v​on ITK w​urde ab 1999 v​on der National Library o​f Medicine gestartet, u​m offene Klassenbibliotheken u​nd Schnittstellen für d​ie Auswertung d​es Visible Human Projects z​u schaffen.[4] Typische Anwendungsgebiete v​on ITK s​ind z. B. d​ie Verarbeitung v​on medizinischen Daten a​us der Computertomographie u​nd der Magnetresonanztomografie. Als Build-System k​ommt CMake z​um Einsatz, welches speziell für ITK entwickelt wurde.[5]

Beispiele

Glättung mithilfe von einem Gaußfilter

 
#include <itkImage.h>
#include <itkImageFileReader.h>
#include <itkImageFileWriter.h>
#include <itkDiscreteGaussianImageFilter.h>

int main(int argc, char *argv[])
{
    typedef itk::Image<unsigned char, 2> ImageType;
    typedef itk::ImageFileReader<ImageType> ReaderType;
    typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;
    typedef itk::DiscreteGaussianImageFilter<ImageType, ImageType> GaussianFilterType;

    ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
    reader->SetFileName("test.jpg");

    GaussianFilterType::Pointer smoothFilter = GaussianFilterType::New();
    smoothFilter->SetInput(reader->GetOutput());
    smoothFilter->SetVariance(3);

    WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
    writer->SetInput(smoothFilter->GetOutput());
    writer->SetFileName("smoothImage.png");

    try
    {
      writer->Update();
    }
    catch( itk::ExceptionObject & excp )
    {
      std::cerr << excp << std::endl;
      return EXIT_FAILURE;
    }

	return EXIT_SUCCESS;
}

Region Growing Segmentierung

 
#include <itkImage.h>
#include <itkImageFileReader.h>
#include <itkImageFileWriter.h>
#include <itkConnectedThresholdImageFilter.h>

int main(int argc, char *argv[])
{
    typedef itk::Image<unsigned char, 3> ImageType;
    typedef itk::ImageFileReader<ImageType> ReaderType;
    typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;
    typedef itk::ConnectedThresholdImageFilter<ImageType, ImageType> RegionFilterType;

    ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
    reader->SetFileName("test.nii");

    ImageType::IndexType seed;
    seed[0] = 142;
    seed[1] =  97;
    seed[2] =  63;

    RegionFilterType::Pointer regionFilter = RegionFilterType::New();
    regionFilter->SetInput(reader->GetOutput());
    regionFilter->SetSeed(seed);

    WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
    writer->SetInput(regionFilter->GetOutput());
    writer->SetFileName("region.nii");

    try
    {
      writer->Update();
    }
    catch( itk::ExceptionObject & excp )
    {
      std::cerr << excp << std::endl;
      return EXIT_FAILURE;
    }

	return EXIT_SUCCESS;
}

Siehe auch
  • Visualization Toolkit

Einzelnachweise
  1. v5.1.1. Abgerufen am 26. August 2020 (englisch).
  2. Insight Software Consortium / ITK - GitHub. Abgerufen am 10. Juni 2020 (englisch).
  3. License. Abgerufen am 10. Juni 2020 (englisch).
  4. History. Abgerufen am 10. Juni 2020 (englisch).
  5. Overview. Abgerufen am 10. Juni 2020 (englisch).
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