Halorubrum virus HRPV1
Halorubrum pleomorphic virus 1 (HRPV1, offiziell Halorubrum virus HRPV1) ist eine Spezies einzelsträngiger DNA-Viren in der Virusfamilie Pleolipoviridae.[2] Seine Wirte sind Archaeen der Gattung Halorubrum aus der der Klasse Halobacteria (Haloarchaeen), Phylum (Abteilung) Euryarchaeota.[3] Es ähnelte keinem anderen zur Zeit seiner Entdeckung bekannten Virus darin, dass sein Genom ein DNA-Einzelstrang ist und es Archaaen infiziert.[4] Die Infektion scheint wie bei anderen Archaeen-Viren ohne finale Lyse (Auflösung und Zerstörung) des Wirts zu erfolgen, der Austritt der Nachkommen-Viren erfolgt wahrscheinlich durch Knospung aus der Zellmembran.
| Halorubrum-Virus HRPV1 | ||||||||||||||||||
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Alphapleolipovirus | ||||||||||||||||||
| Systematik | ||||||||||||||||||
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| Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||||||
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| Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||||||
| Halorubrum virus HRPV1 | ||||||||||||||||||
| Kurzbezeichnung | ||||||||||||||||||
| HRPV1 | ||||||||||||||||||
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Aufbau
Die Virusteilchen (Virionen) sind pleomorph und haben eine äußere Lipidhülle. In der Hülle befinden sich zudem zwei Hauptstrukturproteine:
- VP3 – mit 15 kDa (Kilo-Dalton)
- VP4 – mit 53 kDa.
Das Genom scheint nicht mit einem Nukleoprotein assoziiert zu sein.[3]
Das Spike-Protein (VP4) ist glykosyliert. Spike-Proteine befinden sich normalerweise in der Außenhülle eines Virusteilchens und helfen dem Erreger, in die Wirtszellen einzudringen. Die Lipidhülle der Virionen ist in der Zusammensetzung der des Wirts ähnlich. VP3 ist ein Membranprotein, das offenbar der äußeren Umgebung nicht ausgesetzt ist. Es könnte sein, dass es dazu dient, eine Art Schale um das Genom zu bilden, wie dies bei anderen Viren der Fall ist.[3] Das ist allerdings bisher lediglich eine Vermutung.
Genom
Das Genom ist ein einzelsträngiges DNA-Molekül mit einer Länge von 7048 Basen. Es kodiert 9 Offene Leserahmen (Open Reading Frames, ORFs). Zwei davon kodieren für die Strukturproteine VP3 und VP4. Ein weiteres kodiertes Protein (VP8) scheint eine ATPase zu sein. Die Funktionen der übrigen Proteine sind noch nicht bekannt.[3]
Systematik
Beim Vergleich des Vermehrungszyklus (Eindringen in den Wirt sowie vermuteter Austritt durch Knospung), des Aufbaus der Virionen (Größe von VP3 und VP4) und des Genoms fällt die große Ähnlichkeit mit dem Haloarcula virus HHPV1 (auch Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 genannt) auf, obwohl letzteres ein doppelsträngigens Genom hat (Baltimore-Gruppe 1). Dies war der Grund, sie beide derselben Virusgattung Alphapleolipovirus in der Familie Pleolipoviridae zuzuordnen.[2] Die Bestätigung einer solchen Verwandtschaft für weitere Viren könnte darauf hindeuten, dass das derzeit verwendete Klassifizierungssystem von Baltimore überarbeitet werden muss.
Einzelnachweise
- ICTV: ICTV Taxonomy history: Haloarcula virus HHPV1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ICTV: Master Species List 2018a v1, MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33)
- Pietila, M, Laurinavicius S, Sund, J, Roine E & Bamford D (2009) The single-stranded DNA genome of novel archaeal virus Halorubrum pleomorphic virus 1 Is enclosed in the envelope decorated with glycoprotein spikes. J Virol 84 (2) 788-798 doi:10.1128/JVI.01347-09
- ICTV Online (10th) Report Pleolipoviridae.