Pentapeptide Repeat

Das Pentapeptide Repeat (zu deutsch ‚Pentapeptidwiederholung‘) ist ein Sequenzmotiv in manchen Proteinen.[1][2]

Pentapeptide Repeat

Eigenschaften

Das Pentapeptide Repeat besteht aus Wiederholungseinheiten der Aminosäuresequenz Ala-Asp/Asn-Leu und zwei beliebigen Aminosäuren (kurz: A(D/N)LXX). Die Funktion ist bisher unbekannt, möglicherweise ist das Pentapeptide Repeat ein proteinbasiertes Strukturanalogon von DNA.[3] Einige Proteine mit Pentapeptide Repeat sind als β-Helix aufgebaut, mit einem ungefähr quadratischen Querschnitt.[3]

Einzelnachweise

A. Bateman, A. G. Murzin, S. A. Teichmann: Structure and distribution of pentapeptide repeats in bacteria. In: Protein science : a publication of the Protein Society. Band 7, Nummer 6, Juni 1998, S. 1477–1480, doi:10.1002/pro.5560070625, PMID 9655353, PMC 2144021 (freier Volltext).
M. W. Vetting, S. S. Hegde, J. E. Fajardo, A. Fiser, S. L. Roderick, H. E. Takiff, J. S. Blanchard: Pentapeptide repeat proteins. In: Biochemistry. Band 45, Nummer 1, Januar 2006, S. 1–10, doi:10.1021/bi052130w, PMID 16388575, PMC 2566302 (freier Volltext).
S. Shah, J. G. Heddle: Squaring up to DNA: pentapeptide repeat proteins and DNA mimicry. In: Applied Microbiology and Biotechnology. Band 98, Nummer 23, Dezember 2014, S. 9545–9560, doi:10.1007/s00253-014-6151-3, PMID 25343976.

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[1] A. Bateman, A. G. Murzin, S. A. Teichmann: Structure and distribution of pentapeptide repeats in bacteria. In: Protein science : a publication of the Protein Society. Band 7, Nummer 6, Juni 1998, S. 1477–1480, doi:10.1002/pro.5560070625, PMID 9655353, PMC 2144021 (freier Volltext).

[2] M. W. Vetting, S. S. Hegde, J. E. Fajardo, A. Fiser, S. L. Roderick, H. E. Takiff, J. S. Blanchard: Pentapeptide repeat proteins. In: Biochemistry. Band 45, Nummer 1, Januar 2006, S. 1–10, doi:10.1021/bi052130w, PMID 16388575, PMC 2566302 (freier Volltext).

[Shah-3] S. Shah, J. G. Heddle: Squaring up to DNA: pentapeptide repeat proteins and DNA mimicry. In: Applied Microbiology and Biotechnology. Band 98, Nummer 23, Dezember 2014, S. 9545–9560, doi:10.1007/s00253-014-6151-3, PMID 25343976.