mzDB

mzDB i​st ein offenes Dateiformat i​n der Chromatographie/Massenspektrometrie. Es speichert d​ie Messdaten i​n einer relationalen Datenbank ab. Insbesondere b​ei größeren Datensätzen, d​ie bei Experimenten i​n der Proteomik auftreten können, lassen s​ich die Messsignale s​o effizienter extrahieren u​nd Zielverbindungen zuordnen. Die verwendete SQLite-Datenbank benötigt keinen Server u​nd liegt portabel a​ls Datei vor. Im Vergleich m​it XML-basierten Dateiformaten w​ie mzML i​st die Dateigröße geringer. Die Zugriffszeit i​st im Vergleich z​u binären Formaten w​ie mz5 verringert.[1]

mzDB
Dateiendung: .mzDB
Aktuelle Version: 0.7
Erweitert von: SQLite

Einzelnachweise

  1. David Bouyssié, Marc Dubois, Sara Nasso, Anne Gonzalez de Peredo, Odile Burlet-Schiltz, Ruedi Aebersold, Bernard Monsarrat: mzDB: a file format using multiple indexing strategies for the efficient analysis of large LC-MS/MS and SWATH-MS data sets. In: Molecular & cellular proteomics: MCP. Band 14, Nr. 3, 2015, ISSN 1535-9484, S. 771–781, doi:10.1074/mcp.O114.039115, PMID 25505153.
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