GlycomeDB

GlycomeDB (zu Deutsch ‚Glykom-Datenbank‘) ist eine biochemische Online-Datenbank, die strukturelle und taxonomische Daten zu Kohlenhydraten enthält.[1]

Eigenschaften

GlycomeDB wurde 2006 eingerichtet und wird vom deutschen Krebsforschungszentrum betrieben.[2] Sie führt unter anderem die Daten aus der Complex Carbohydrate Structure Database (CCSD), der Bacterial Carbohydrate Structure Database (BCSDB), des Consortium for Functional Glycomics (CFG) und der Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) und stellt die gebündelten Ergebnisse auf einer Benutzeroberfläche dar.

GlycomeDB ist Teil eines Verbundprojekts mit dem Japan Consortium for Glycobiology and Glycotechnology DataBase (JCGGDB) und der UniCarbKB.[3]

Weblinks

GlycomeDB. Abgerufen am 29. Juni 2014.

Einzelnachweise

R. Ranzinger, S. Herget, C. W. von der Lieth, M. Frank: GlycomeDB–a unified database for carbohydrate structures. In: Nucleic acids research. Band 39, Database issueJanuar 2011, S. D373–D376, ISSN 1362-4962. doi:10.1093/nar/gkq1014. PMID 21045056. PMC 3013643 (freier Volltext).
R. Ranzinger, S. Herget, T. Wetter, C. W. von der Lieth: GlycomeDB - integration of open-access carbohydrate structure databases. In: BMC Bioinformatics. Band 9, 2008, S. 384, ISSN 1471-2105. doi:10.1186/1471-2105-9-384. PMID 18803830. PMC 2567997 (freier Volltext).
K. F. Aoki-Kinoshita, J. Bolleman, M. P. Campbell, S. Kawano, J. D. Kim, T. Lütteke, M. Matsubara, S. Okuda, R. Ranzinger, H. Sawaki, T. Shikanai, D. Shinmachi, Y. Suzuki, P. Toukach, I. Yamada, N. H. Packer, H. Narimatsu: Introducing glycomics data into the Semantic Web. In: Journal of biomedical semantics. Band 4, Nummer 1, 2013, S. 39, ISSN 2041-1480. doi:10.1186/2041-1480-4-39. PMID 24280648.

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[1] R. Ranzinger, S. Herget, C. W. von der Lieth, M. Frank: GlycomeDB–a unified database for carbohydrate structures. In: Nucleic acids research. Band 39, Database issueJanuar 2011, S. D373–D376, ISSN 1362-4962. doi:10.1093/nar/gkq1014. PMID 21045056. PMC 3013643 (freier Volltext).

[2] R. Ranzinger, S. Herget, T. Wetter, C. W. von der Lieth: GlycomeDB - integration of open-access carbohydrate structure databases. In: BMC Bioinformatics. Band 9, 2008, S. 384, ISSN 1471-2105. doi:10.1186/1471-2105-9-384. PMID 18803830. PMC 2567997 (freier Volltext).

[3] K. F. Aoki-Kinoshita, J. Bolleman, M. P. Campbell, S. Kawano, J. D. Kim, T. Lütteke, M. Matsubara, S. Okuda, R. Ranzinger, H. Sawaki, T. Shikanai, D. Shinmachi, Y. Suzuki, P. Toukach, I. Yamada, N. H. Packer, H. Narimatsu: Introducing glycomics data into the Semantic Web. In: Journal of biomedical semantics. Band 4, Nummer 1, 2013, S. 39, ISSN 2041-1480. doi:10.1186/2041-1480-4-39. PMID 24280648.