AMDIS

AMDIS
Basisdaten
Maintainer	NIST
Entwickler	Stephen Stein
Erscheinungsjahr	1999
Aktuelle Version	121.86 ; (13. August 2008)
Betriebssystem	Microsoft Windows
Kategorie	Chemometrik
deutschsprachig	nein

AMDIS (Automated Mass Spectrometry Deconvolution and Identification System) ist ein vom National Institute of Standards and Technology entwickeltes Werkzeug zur Dekonvolution von überlagernden Peaks in der Gaschromatographie mit Massenspektrometrie-Kopplung. Dabei sucht der Algorithmus nach typischen Peakformen, zieht verrauschte Signale ab und extrahiert digital aufgereinigte Spektren, die dann einer Datenbanksuche unterzogen werden können.[1]

Anwendung

Entwickelt wurde AMDIS ursprünglich, um die Durchsetzung der Chemiewaffenkonvention weltweit durch Laboranalysen von Verdachtsfällen zu erleichtern.[2] Mittlerweile gibt es jedoch auch zahlreiche zivile Anwendungen. So können mittels AMDIS in der klinischen Toxikologie Drogen, Gifte und deren Metabolite im Urin von Patienten nachgewiesen werden, um dann in der Notfallmedizin schnell Gegenmaßnahmen einzuleiten. Zudem kann es Anwendung in der forensischen Toxikologie finden.[3] Es kann auch dazu verwendet werden Stoffwechselstörungen zu diagnostizieren.[4] Ein weiteres Anwendungsfeld ist die Metabolomik.[5] In der Analytik von Aromen findet AMDIS Anwendung, da dort Spurenstoffe ebenfalls entscheidend sein können.[6][7] In der Lebensmittelanalytik kann es zum Nachweis von Pestiziden verwendet werden.[8] Innerhalb der analytischen Pyrolyse-GC/MS, die komplexe Chromatogramme erzeugt, findet es ebenfalls Anwendung.[9]

Weblinks

Offizielle Website
AMDIS im NIST DokuWiki

Einzelnachweise

S. E. Stein: An integrated method for spectrum extraction and compound identification from gas chromatography/mass spectrometry data. In: Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Band 10, Nr. 8, 1999, ISSN 1044-0305, S. 770–781, doi:10.1016/S1044-0305(99)00047-1.
W. Gary Mallard: AMDIS in the Chemical Weapons Convention. In: Analytical and Bioanalytical Chemistry. Band 406, Nr. 21, 2014, ISSN 1618-2650, S. 5075–5086, doi:10.1007/s00216-014-7686-y.
Markus R. Meyer, Frank T. Peters, Hans H. Maurer: Automated mass spectral deconvolution and identification system for GC-MS screening for drugs, poisons, and metabolites in urine. In: Clinical Chemistry. Band 56, Nr. 4, 2010, ISSN 1530-8561, S. 575–584, doi:10.1373/clinchem.2009.135517, PMID 20185625.
J. M. Halket, A. Przyborowska, S. E. Stein, W. G. Mallard, S. Down, R. A. Chalmers: Deconvolution gas chromatography/mass spectrometry of urinary organic acids--potential for pattern recognition and automated identification of metabolic disorders. In: Rapid communications in mass spectrometry: RCM. Band 13, Nr. 4, 1999, ISSN 0951-4198, S. 279–284, doi:10.1002/(SICI)1097-0231(19990228)13:4<279::AID-RCM478>3.0.CO;2-I, PMID 10097403.
Volker Behrends, Gregory D. Tredwell, Jacob G. Bundy: A software complement to AMDIS for processing GC-MS metabolomic data. In: Analytical Biochemistry. Band 415, Nr. 2, 2011, ISSN 1096-0309, S. 206–208, doi:10.1016/j.ab.2011.04.009, PMID 21575589.
Lijun Wu, Wei Liu, Jinli Cao, Qianqian Li, Yue Huang, Shungeng Min: Analysis of the aroma components in tobacco using combined GC-MS and AMDIS. In: Analytical Methods. Band 5, Nr. 5, 2013, ISSN 1759-9679, S. 1259–1263, doi:10.1039/C2AY26102B.
Manuela Cerdán-Calero, Luís Izquierdo, Enrique Sentandreu: Valencia Late orange juice preserved by pulp reduction and high pressure homogenization: Sensory quality and gas chromatography–mass spectrometry analysis of volatiles. In: LWT - Food Science and Technology. Band 51, Nr. 2, 2013, ISSN 0023-6438, S. 476–483, doi:10.1016/j.lwt.2012.11.016.
Weiguo Zhang, Ping Wu, Chongjiu Li: Study of automated mass spectral deconvolution and identification system (AMDIS) in pesticide residue analysis. In: Rapid Communications in Mass Spectrometry. Band 20, Nr. 10, 2006, ISSN 0951-4198, S. 1563–1568, doi:10.1002/rcm.2473.
Mark M. Smits, Robert Carleer, Jan V. Colpaert: PYQUAN: A rapid workflow around the AMDIS deconvolution software for high throughput analysis of pyrolysis GC/MS data. In: Journal of Analytical and Applied Pyrolysis. Band 118, 2016, ISSN 0165-2370, S. 335–342, doi:10.1016/j.jaap.2016.01.006.

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[1] S. E. Stein: An integrated method for spectrum extraction and compound identification from gas chromatography/mass spectrometry data. In: Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Band 10, Nr. 8, 1999, ISSN 1044-0305, S. 770–781, doi:10.1016/S1044-0305(99)00047-1.

[2] W. Gary Mallard: AMDIS in the Chemical Weapons Convention. In: Analytical and Bioanalytical Chemistry. Band 406, Nr. 21, 2014, ISSN 1618-2650, S. 5075–5086, doi:10.1007/s00216-014-7686-y.

[3] Markus R. Meyer, Frank T. Peters, Hans H. Maurer: Automated mass spectral deconvolution and identification system for GC-MS screening for drugs, poisons, and metabolites in urine. In: Clinical Chemistry. Band 56, Nr. 4, 2010, ISSN 1530-8561, S. 575–584, doi:10.1373/clinchem.2009.135517, PMID 20185625.

[4] J. M. Halket, A. Przyborowska, S. E. Stein, W. G. Mallard, S. Down, R. A. Chalmers: Deconvolution gas chromatography/mass spectrometry of urinary organic acids--potential for pattern recognition and automated identification of metabolic disorders. In: Rapid communications in mass spectrometry: RCM. Band 13, Nr. 4, 1999, ISSN 0951-4198, S. 279–284, doi:10.1002/(SICI)1097-0231(19990228)13:4<279::AID-RCM478>3.0.CO;2-I, PMID 10097403.

[5] Volker Behrends, Gregory D. Tredwell, Jacob G. Bundy: A software complement to AMDIS for processing GC-MS metabolomic data. In: Analytical Biochemistry. Band 415, Nr. 2, 2011, ISSN 1096-0309, S. 206–208, doi:10.1016/j.ab.2011.04.009, PMID 21575589.

[6] Lijun Wu, Wei Liu, Jinli Cao, Qianqian Li, Yue Huang, Shungeng Min: Analysis of the aroma components in tobacco using combined GC-MS and AMDIS. In: Analytical Methods. Band 5, Nr. 5, 2013, ISSN 1759-9679, S. 1259–1263, doi:10.1039/C2AY26102B.

[7] Manuela Cerdán-Calero, Luís Izquierdo, Enrique Sentandreu: Valencia Late orange juice preserved by pulp reduction and high pressure homogenization: Sensory quality and gas chromatography–mass spectrometry analysis of volatiles. In: LWT - Food Science and Technology. Band 51, Nr. 2, 2013, ISSN 0023-6438, S. 476–483, doi:10.1016/j.lwt.2012.11.016.

[8] Weiguo Zhang, Ping Wu, Chongjiu Li: Study of automated mass spectral deconvolution and identification system (AMDIS) in pesticide residue analysis. In: Rapid Communications in Mass Spectrometry. Band 20, Nr. 10, 2006, ISSN 0951-4198, S. 1563–1568, doi:10.1002/rcm.2473.

[9] Mark M. Smits, Robert Carleer, Jan V. Colpaert: PYQUAN: A rapid workflow around the AMDIS deconvolution software for high throughput analysis of pyrolysis GC/MS data. In: Journal of Analytical and Applied Pyrolysis. Band 118, 2016, ISSN 0165-2370, S. 335–342, doi:10.1016/j.jaap.2016.01.006.